Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 1 | 5'-D(*GP*TP*GP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*TP*G)-3' × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | CDC13_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–199； UniProt 497–694 |
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| 条目编号 entry_id | 1s40 |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-01-14 |
| 结构标题 title | SOLUTION STRUCTURE OF THE CDC13 DNA-BINDING DOMAIN COMPLEXED WITH A SINGLE-STRANDED TELOMERIC DNA 11-MER |
| 关键词 keywords | ssDNA, single-stranded nucleic acid, recognition, specificity, cdc13, OB-fold, telomere, CELL CYCLE-DNA COMPLEX; CELL CYCLE/DNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 7 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.09 Å |
| Rg（电子密度） | 16.76 Å |
| 总 Rg | 17.76 Å |
| 原子数 | 3457 |
| 残基数 | 198 |
| 排除体积 | 31243 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1s40__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 1s40__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 1s40__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 1s40__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 1s40__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 1s40__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 1s40__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 1s40__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 1s40__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 1s40__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1s40a_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.40 — OB-fold |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins |
| 家族 Family family | b.40.4.3 — Single strand DNA-binding domain, SSB |
| 结构域编号 domain_id | 1s40A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — Nucleic acid-binding proteins |