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1s4f

Crystal Structure of RNA-dependent RNA polymerase construct 2 from bovine viral diarrhea virus (BVDV)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-dependent RNA polymerase

Bovine viral diarrhea virus 1

UniProt P19711

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
6 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1s48 1s49 1s4f 1s4f 1s4f 1s4f

共 6 个 assembly

同源二聚体
1s48 1s49 1s4f 1s4f

共 4 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
4ild 4jnt

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLG_BVDVN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–601； UniProt 3348–3948 作者链 B； PDB构建体 1–601； UniProt 3348–3948 作者链 C； PDB构建体 1–601； UniProt 3348–3948 作者链 D； PDB构建体 1–601； UniProt 3348–3948

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1s4f
沉积日期 deposition_date2004-01-16
结构标题 titleCrystal Structure of RNA-dependent RNA polymerase construct 2 from bovine viral diarrhea virus (BVDV)
关键词 keywords;Polymerase, RNA synthesis, primer independent initiation, de novo initiation, bovine viral diarrhea virus, BVDV, REPLICATION, RNA BINDING PROTEIN ;; REPLICATION, RNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1s4f__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1s4f__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1s4f__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）26.78 Å
Rg（电子密度）25.93 Å
总 Rg26.78 Å
原子数4697
残基数583
排除体积83813 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1s4f__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1s4f__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1s4f__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 1s4f__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 1s4f__assembly_5__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 1s4f__assembly_6__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1s4fa_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase
结构域编号 domain_idd1s4fb_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase
结构域编号 domain_idd1s4fc_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase
结构域编号 domain_idd1s4fd_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.4 — RNA-dependent RNA-polymerase

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1s4fA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id1s4fB04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id1s4fC04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id1s4fD04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
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7. 引用文献 (1)