Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | water × 4 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DAPA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–292； UniProt 1–292 作者链 B； PDB构建体 1–292； UniProt 1–292 |
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| 条目编号 entry_id | 1s5v |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-01-21 |
| 结构标题 title | Crystal Structure Analysis of a mutant of DIHYDRODIPICOLINATE SYNTHASE--residue Tyr107 to Phe107 |
| 关键词 keywords | SYNTHASE, DIHYDRODIPICOLINATE, LYASE; LYASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.24 Å |
| Rg（电子密度） | 18.04 Å |
| 总 Rg | 18.92 Å |
| 原子数 | 2154 |
| 残基数 | 292 |
| 排除体积 | 38447 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1s5v__assembly_1__model_1 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1s5v__assembly_2__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 3 | 1 | 1s5v__assembly_3__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 4 | 1 | 1s5v__assembly_4__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1s5va_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.10 — Aldolase |
| 家族 Family family | c.1.10.1 — Class I aldolase |
| 结构域编号 domain_id | d1s5vb_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.1 — TIM beta/alpha-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.1.10 — Aldolase |
| 家族 Family family | c.1.10.1 — Class I aldolase |
| 结构域编号 domain_id | 1s5vA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 70 — Aldolase class I |
| 结构域编号 domain_id | 1s5vB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Alpha-Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 20 — TIM Barrel |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 70 — Aldolase class I |