Calcium-dependent protein kinase SK5
Glycine max
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CALCIUM ION × 4 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CDPK_SOYBN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–182； UniProt 329–508 |
1s6i
Ca2+-regulatory region (CLD) from soybean calcium-dependent protein kinase-alpha (CDPK) in the presence of Ca2+ and the junction domain (JD)
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1s6i |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-01-23 |
| 结构标题 title | Ca2+-regulatory region (CLD) from soybean calcium-dependent protein kinase-alpha (CDPK) in the presence of Ca2+ and the junction domain (JD) |
| 关键词 keywords | EF-hand; helix-loop-helix; calcium-binding; calmodulin superfamily, TRANSFERASE, PLANT PROTEIN; TRANSFERASE, PLANT PROTEIN |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1s6i__assembly_1__model_7
Assembly 1 · Model 7 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1s6i__assembly_1__model_7 | I(q)
1s6i__assembly_1__model_7 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 21.36 Å |
| Rg（电子密度） | 20.66 Å |
| 总 Rg | 21.46 Å |
| 原子数 | 2821 |
| 残基数 | 182 |
| 排除体积 | 25344 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1s6i__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 1s6i__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 1s6i__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 1s6i__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 1s6i__assembly_1__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 1s6i__assembly_1__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 1s6i__assembly_1__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 1s6i__assembly_1__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 1s6i__assembly_1__model_9 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 1s6i__assembly_1__model_10 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 1s6i__assembly_1__model_11 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 1s6i__assembly_1__model_12 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 1s6i__assembly_1__model_13 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 1s6i__assembly_1__model_14 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 1s6i__assembly_1__model_15 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1s6ia_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.39 — EF Hand-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.39.1 — EF-hand |
| 家族 Family family | a.39.1.5 — Calmodulin-like |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1s6iA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 238 — Recoverin; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — EF-hand |
| 结构域编号 domain_id | 1s6iA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 238 — Recoverin; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — EF-hand |