1s7m

Crystal Structure of HiaBD1

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hia

Haemophilus influenzae

UniProt Q48152

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 water × 3 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q48152_HAEIN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 8–166; UniProt 548–706 作者链 B; PDB构建体 8–166; UniProt 548–706 作者链 C; PDB构建体 8–166; UniProt 548–706 作者链 D; PDB构建体 8–166; UniProt 548–706 作者链 E; PDB构建体 8–166; UniProt 548–706 作者链 F; PDB构建体 8–166; UniProt 548–706

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1s7m
沉积日期 deposition_date2004-01-29
结构标题 titleCrystal Structure of HiaBD1
关键词 keywordsadhesion, homotrimer, autotransporter, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1s7m__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1s7m__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1s7m__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.74 Å
Rg(电子密度)24.03 Å
总 Rg24.92 Å
原子数3437
残基数472
排除体积60038 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1s7m__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1s7m__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1s7m__assembly_3__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1s7ma_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.144 — Trimeric adhesin
超家族 Superfamily superfamilyb.144.1 — Trimeric adhesin
家族 Family familyb.144.1.1 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_idd1s7mb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.144 — Trimeric adhesin
超家族 Superfamily superfamilyb.144.1 — Trimeric adhesin
家族 Family familyb.144.1.1 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_idd1s7mc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.144 — Trimeric adhesin
超家族 Superfamily superfamilyb.144.1 — Trimeric adhesin
家族 Family familyb.144.1.1 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_idd1s7md_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.144 — Trimeric adhesin
超家族 Superfamily superfamilyb.144.1 — Trimeric adhesin
家族 Family familyb.144.1.1 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_idd1s7me_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.144 — Trimeric adhesin
超家族 Superfamily superfamilyb.144.1 — Trimeric adhesin
家族 Family familyb.144.1.1 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_idd1s7mf_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.144 — Trimeric adhesin
超家族 Superfamily superfamilyb.144.1 — Trimeric adhesin
家族 Family familyb.144.1.1 — Trimeric adhesin

CATH v4.4 (18 domains)

结构域编号 domain_id1s7mA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1780 — Trimeric adhesin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_id1s7mA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1780 — Trimeric adhesin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_id1s7mB03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1780 — Trimeric adhesin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_id1s7mC03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1780 — Trimeric adhesin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_id1s7mD03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mE01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1780 — Trimeric adhesin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_id1s7mE03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mF01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id1s7mF02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1780 — Trimeric adhesin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trimeric adhesin
结构域编号 domain_id1s7mF03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
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7. 引用文献 (1)