1s96

The 2.0 A X-ray structure of Guanylate Kinase from E.coli

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanylate kinase

Escherichia coli

UniProt P60546

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 PHOSPHATE ION × 2 UNKNOWN ATOM OR ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 PHOSPHATE ION × 6 UNKNOWN ATOM OR ION × 3 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KGUA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 13–219; UniProt 1–207 作者链 B; PDB构建体 13–219; UniProt 1–207

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1s96
沉积日期 deposition_date2004-02-03
结构标题 titleThe 2.0 A X-ray structure of Guanylate Kinase from E.coli
关键词 keywordsguanylate kinase, E.coli, dimer, SAD, transferase; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1s96__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 1s96__assembly_2__model_1 hexameric (6) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1s96a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.1 — Nucleotide and nucleoside kinases
结构域编号 domain_idd1s96b_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.1 — Nucleotide and nucleoside kinases

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1s96A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1s96A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology63 — Guanylate Kinase phosphate binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Guanylate Kinase phosphate binding domain
结构域编号 domain_id1s96B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1s96B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology63 — Guanylate Kinase phosphate binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Guanylate Kinase phosphate binding domain
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7. 引用文献 (1)