Caenorhabditis elegans
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*TP*GP*AP*CP*AP*AP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*CP*CP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*AP*GP*GP*GP*AP*TP*GP*AP*CP*AP*TP*TP*GP*T)-3') ; × 1 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | SKN1_CAEEL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 P； PDB构建体 9–92； UniProt 450–533 |
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| 条目编号 entry_id | 1skn |
| 沉积日期 deposition_date | 1998-03-30 |
| 结构标题 title | THE BINDING DOMAIN OF SKN-1 IN COMPLEX WITH DNA: A NEW DNA-BINDING MOTIF |
| 关键词 keywords | COMPLEX (TRANSCRIPTION FACTOR-DNA), TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.64 Å |
| Rg（电子密度） | 17.14 Å |
| 总 Rg | 17.91 Å |
| 原子数 | 1235 |
| 残基数 | 104 |
| 排除体积 | 19975 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1sknp_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.37 — A DNA-binding domain in eukaryotic transcription factors |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.37.1 — A DNA-binding domain in eukaryotic transcription factors |
| 家族 Family family | a.37.1.1 — A DNA-binding domain in eukaryotic transcription factors |
| 结构域编号 domain_id | 1sknP00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 880 — Transcription Factor Skn-1; Chain P |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Transcription factor, Skn-1-like, DNA-binding domain |