1spu

STRUCTURE OF OXIDOREDUCTASE

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COPPER AMINE OXIDASE

物种未注明

UniProt P46883

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 COPPER (II) ION × 2 CALCIUM ION × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AMO_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–727; UniProt 31–757 作者链 B; PDB构建体 1–727; UniProt 31–757

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1spu
沉积日期 deposition_date1996-11-13
结构标题 titleSTRUCTURE OF OXIDOREDUCTASE
关键词 keywordsOXIDOREDUCTASE, COPPER, TPQ, PERIPLASMIC; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1spu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1spu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1spu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)33.78 Å
Rg(电子密度)33.09 Å
总 Rg33.80 Å
原子数11367
残基数1436
排除体积201850 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1spu__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd1spua1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.30 — Supersandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.30.2 — Amine oxidase catalytic domain
家族 Family familyb.30.2.1 — Amine oxidase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1spua2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1spua3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1spua4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.82 — N domain of copper amine oxidase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.82.1 — Copper amine oxidase, domain N
家族 Family familyd.82.1.1 — Copper amine oxidase, domain N
结构域编号 domain_idd1spub1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.30 — Supersandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.30.2 — Amine oxidase catalytic domain
家族 Family familyb.30.2.1 — Amine oxidase catalytic domain
结构域编号 domain_idd1spub2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1spub3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.2 — Amine oxidase N-terminal region
家族 Family familyd.17.2.1 — Amine oxidase N-terminal region
结构域编号 domain_idd1spub4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.82 — N domain of copper amine oxidase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.82.1 — Copper amine oxidase, domain N
家族 Family familyd.82.1.1 — Copper amine oxidase, domain N

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1spuA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology457 — Copper Amine Oxidase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Copper amine oxidase-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1spuA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1spuA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology98 — Beta-galactosidase; Chain A, domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Copper amine oxidase, catalytic domain
结构域编号 domain_id1spuA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1spuB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology457 — Copper Amine Oxidase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Copper amine oxidase-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1spuB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40
结构域编号 domain_id1spuB03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology98 — Beta-galactosidase; Chain A, domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Copper amine oxidase, catalytic domain
结构域编号 domain_id1spuB04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40

7. 引用文献 (2)