1sua

SUBTILISIN BPN'

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 51.6 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;SUBTILISIN BPN' ;

Bacillus amyloliquefaciens

UniProt P00782

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 108–382 突变:DEL(75-83), K43N, M50F, G73A, Q206V, Y217K, N218S, S221A, Q271E TETRAPEPTIDE ALA-LEU-ALA-LEU × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;1.25M LI2SO4 0.1M HEPES/HCL PH7.5 分辨率 2.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 62 个其他 PDB 条目、82 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SUBT_BACAM
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–266; UniProt 108–382

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1sua

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1sua
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1sua
沉积日期 deposition_date1997-01-14
结构标题 titleSUBTILISIN BPN'
关键词 keywordsCOMPLEX (HYDROLASE-PEPTIDE), HYDROLASE, SERINE PROTEINASE, COMPLEX (HYDROLASE-PEPTIDE) complex; COMPLEX (HYDROLASE/PEPTIDE)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.61
回转半径 Rg (电子) rg_electron16.39
零角强度 I(0) i013056200.00
分子量 molecular_weight26658.0 kDa
排除体积 excluded_volume33142 ų
包络体积 envelope_volume35947 ų
水化壳体积 shell_volume17855 ų
包络直径 envelope_diameter51.6
壳层 Rg shell_rg23.03
包络 Rg envelope_rg16.64
形状 Rg shape_rg16.41
总 Rg total_rg17.32
总原子数 total_atoms1878
残基数 n_residues267
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.6
Rg (实空间) rg_real17.45
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.19
I(0) (实空间) i0_real1.3060e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2310e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal17.47
I(0) (倒空间) i0_reciprocal13060000.0000
解质量估计 total_estimate0.9084
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary23.4
偏度 Skewness skewness0.033
峰度 Kurtosis kurtosis-0.533
角度范围 angular_range— – 0.4500 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4183000.0000
实空间数据点数 n_real_points76
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.947; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.988

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1suaa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.41 — Subtilisin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.41.1 — Subtilisin-like
家族 Family familyc.41.1.1 — Subtilases

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1suaA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily200 — Peptidase S8/S53 domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)