1t0s

Structure of the Toluene/o-Xylene Monooxygenase Hydroxylase with 4-bromophenol bound

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit

Pseudomonas stutzeri

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 2 （O87802） touB × 2 （O87799） FE (III) ION × 4 HYDROXIDE ION × 2 SULFANYLACETIC ACID × 2 4-BROMOPHENOL × 12 water × 6	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 1 （O87802） touB × 1 （O87799） FE (III) ION × 2 HYDROXIDE ION × 1 SULFANYLACETIC ACID × 1 4-BROMOPHENOL × 6 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O87798_PSEST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–498； UniProt 1–498

toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit

Pseudomonas stutzeri

UniProt O87802

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 2 （O87798） touB × 2 （O87799） FE (III) ION × 4 HYDROXIDE ION × 2 SULFANYLACETIC ACID × 2 4-BROMOPHENOL × 12 water × 6	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 1 （O87798） touB × 1 （O87799） FE (III) ION × 2 HYDROXIDE ION × 1 SULFANYLACETIC ACID × 1 4-BROMOPHENOL × 6 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O87802_PSEST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–330； UniProt 1–330

touB

Pseudomonas stutzeri

UniProt O87799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 2 （O87798） toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 2 （O87802） FE (III) ION × 4 HYDROXIDE ION × 2 SULFANYLACETIC ACID × 2 4-BROMOPHENOL × 12 water × 6	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 1 （O87798） toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit × 1 （O87802） FE (III) ION × 2 HYDROXIDE ION × 1 SULFANYLACETIC ACID × 1 4-BROMOPHENOL × 6 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O87799_PSEST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1t0s
沉积日期 deposition_date	2004-04-12
结构标题 title	Structure of the Toluene/o-Xylene Monooxygenase Hydroxylase with 4-bromophenol bound
关键词 keywords	diiron, 4-bromophenol, channel, 4-helix bundle, carboxylate bridge, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1t0s__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1t0s__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1t0s__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.51 Å
Rg（电子密度）	29.97 Å
总 Rg	30.55 Å
原子数	7400
残基数	897
排除体积	130520 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1t0s__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1t0s__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit
分子量 formula_weight	57786.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7667

MSMLKREDWYDLTRTTNWTPKYVTENELFPEEMSGARGISMEAWEKYDEPYKITYPEYVSIQREKDSGAYSIKAALERDGFVDRADPGWVSTMQLHFGAIALEEYAASTAEARMARFAKAPGNRNMATFGMMDENRHGQIQLYFPYANVKRSRKWDWAHKAIHTNEWAAIAARSFFDDMMMTRDSVAVSIMLTFAFETGFTNMQFLGLAADAAEAGDHTFASLISSIQTDESRHAQQGGPSLKILVENGKKDEAQQMVDVAIWRSWKLFSVLTGPIMDYYTPLESRNQSFKEFMLEWIVAQFERQLLDLGLDKPWYWDQFMQDLDETHHGMHLGVWYWRPTVWWDPAAGVSPEEREWLEEKYPGWNDTWGQCWDVITDNLVNGKPELTVPETLPTICNMCNLPIAHTPGNKWNVKDYQLEYEGRLYHFGSEADRWCFQIDPERYKNHTNLVDRFLKGEIQPADLAGALMYMSLEPGVMGDDAHDYEWVKAYQKKTNAA

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas stutzeri
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	316
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit
分子量 formula_weight	38381.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSEQQPEALKPLKTWSHLAGNRRRPSEYEVVSTNLHYFTDNPERPWELDSNLPMQTWYKKYCFDSPLKHDDWNAFRDPDQLVYRTYNLLQDGQESYVQGLFDQLNDRGHDQMLTREWVETLARFYTPARYLFHALQMGSVYIHQIAPASTITNCATYETADHLRWLTHTAYRTRELANCYPDVGFGKRERDVWENDPAWQGFRELIEKALIAWDWGEAFTAINLVTKPAVEEALLQQLGSLAQSEGDTLLGLLAQAQKRDAERHRRWSSALVKMALEKEGNREVLQKWVAKWEPLADKAIEAYCSALPDGENAIVEAKSASRYVRQMMGL

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas stutzeri
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	316
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	touB
分子量 formula_weight	9986.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MATFPIMSNFERDFVIQLVPVDTEDTMDQVAEKCAYHSINRRVHPQPEKILRVRRHEDGTLFPRGMIVSDAGLRPTETLDIIFMDN

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas stutzeri
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	316
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	HYDROXIDE ION
分子量 formula_weight	17.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFANYLACETIC ACID
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	4-BROMOPHENOL
分子量 formula_weight	173.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	267

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1t0sa_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d1t0sb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d1t0sc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.12 — TmoB-like
家族 Family family	d.15.12.1 — TmoB-like

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1t0sA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	1t0sB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	1t0sC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	270 — TmoB-like

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晶胞边长 a length_a	183.242 Å
晶胞边长 b length_b	183.242 Å
晶胞边长 c length_c	67.671 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	29.470 Å
R 因子 r_factor	0.2360
R_work r_work	0.2360
R_free r_free	0.2730

Structure of the Toluene/o-Xylene Monooxygenase Hydroxylase with 4-bromophenol bound

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

touB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1t0s__assembly_2__model_1

1t0s__assembly_2__model_1 | I(q)

1t0s__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the Toluene/o-Xylene Monooxygenase Hydroxylase with 4-bromophenol bound

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

toluene, o-xylene monooxygenase oxygenase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

touB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1t0s__assembly_2__model_1

1t0s__assembly_2__model_1 | I(q)

1t0s__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)