TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
Trypanosoma cruzi
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 3–251 链 B； UniProt 3–251 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；pH 7.5 | 分辨率 1.83 Å R-free 0.258 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1TCD | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CI1 CRYSTAL STRUCTURE OF TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE FROM TRYPANOSOMA CRUZI IN HEXANE 提交 1999-04-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–251（251 aa）
链 B
1–251（251 aa）
|
未记录 | HEX HEXANE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED AT ROOM
TEMPERATUTE BY VAPER DIFFUSION FROM
0.1 M NA HEPES PH7.5, 2%(V/V) PEG400 AND
2.0 M AMMONIUM SULFATE, THEN SOAKED IN
ANHYDROUS N-HEXANE.
, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.239 |
| 1SUX CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF THE COMPLEX BETWEEN TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE FROM TRYPANOSOMA CRUZI AND 3-(2-benzothiazolylthio)-1-propanesulfonic acid 提交 2004-03-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–251（251 aa）
链 B
1–251（251 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 7 BTS 3-(2-BENZOTHIAZOLYLTHIO)-1-PROPANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；PEG 400, HEPES, ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.196 |
| 2OMA Crystallographic analysis of a chemically modified triosephosphate isomerase from Trypanosoma cruzi with dithiobenzylamine (DTBA) 提交 2007-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
2–251（250 aa）
链 B
2–251（250 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；5 MICROL OF THE PROTEIN SOLUTION WERE MIXED WITH 5 MICROL OF 2 % POLYETHYLENE GLYCOL 400, 0.1 M HEPES, 2.0M AMMONIUM SULFATE, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K, PH 7.50. CRYSTAL SOAKED IN
DITHIOBENZYLAMINE
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.250 |
| 2V5B The monomerization of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma cruzi 提交 2008-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–68（68 aa）
片段：RESIDUES 1-68,84-251
链 A
84–251（168 aa）
片段：RESIDUES 1-68,84-251
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；282 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 9 DEGREES. RESERVOIR SOLUTION OF 100 MM HEPES, PH 7.5, 10% PEG 6000, AND 5% 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL. THE CRYSTALS WERE CRYOPROTECTED BY ADDING PEG 400 30% TO THE RESERVOIR. THEY WERE IMMEDIATELY FROZEN IN LIQUID NITROGEN.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.257 |
| 2V5B The monomerization of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma cruzi 提交 2008-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–68（68 aa）
片段：RESIDUES 1-68,84-251
链 A
84–251（168 aa）
片段：RESIDUES 1-68,84-251
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；282 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 9 DEGREES. RESERVOIR SOLUTION OF 100 MM HEPES, PH 7.5, 10% PEG 6000, AND 5% 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL. THE CRYSTALS WERE CRYOPROTECTED BY ADDING PEG 400 30% TO THE RESERVOIR. THEY WERE IMMEDIATELY FROZEN IN LIQUID NITROGEN.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.257 |
| 3Q37 Identification of Amino Acids that Account for Long-Range Interactions in Proteins Using Two Triosephosphate Isomerases from Pathogenic Trypanosomes. 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
35–90（56 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
链 A
121–251（131 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
链 B
35–90（56 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
链 B
121–251（131 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；278 K；0.2 Sodium malonate, 20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
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分辨率 1.65 Å R-free 0.220 |
| 3Q37 Identification of Amino Acids that Account for Long-Range Interactions in Proteins Using Two Triosephosphate Isomerases from Pathogenic Trypanosomes. 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
35–90（56 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
链 C
121–251（131 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
链 D
35–90（56 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
链 D
121–251（131 aa）
片段：UNP P04789 residues 2-35 and 92-119, UNP P52270 residues 35-92 and 121-251
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；278 K；0.2 Sodium malonate, 20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.220 |
| 4HHP Crystal structure of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi, mutant e105d 提交 2012-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–251（251 aa）
链 B
1–251（251 aa）
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突变：E105D 突变：E105D | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.6；281.15 K；25% w/v PEG monomethyl ether 2000, 0.1 M Tris pH 8.6, 0.01 M Nickel (II) chloride hexahydrate, 5% w/v n-dodecyl-N,N-dimethylamin-N-oxide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 281.15K
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分辨率 1.50 Å R-free 0.196 |
共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TPIS_TRYCR |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–249； UniProt 3–251 作者链 B； PDB构建体 1–249； UniProt 3–251 |
