SAXSdb — 1te1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

xylanase inhibitor protein I

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	endo-1,4-xylanase × 1 （Q9HFH0） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 1,2-ETHANEDIOL × 11 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	XIP1_WHEAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 31–304

endo-1,4-xylanase

Penicillium funiculosum

UniProt Q9HFH0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	xylanase inhibitor protein I × 1 （Q8L5C6） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 1,2-ETHANEDIOL × 11 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9HFH0_PENFN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–190； UniProt 34–223

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1te1
沉积日期 deposition_date	2004-05-24
结构标题 title	Crystal structure of family 11 xylanase in complex with inhibitor (XIP-I)
关键词 keywords	BETA/ALPHA BARREL (XIP-I) and BETA JELLY ROLL (GH11), HYDROLASE INHIBITOR-HYDROLASE COMPLEX; HYDROLASE INHIBITOR/HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1te1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1te1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1te1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.08 Å
Rg（电子密度）	23.15 Å
总 Rg	24.00 Å
原子数	3675
残基数	464
排除体积	64447 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1te1__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	xylanase inhibitor protein I
分子量 formula_weight	30324.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3875

AGGKTGQVTVFWGRNKAEGSLREACDSGMYTMVTMSFLDVFGANGKYHLDLSGHDLSSVGADIKHCQSKGVPVSLSIGGYGTGYSLPSNRSALDLFDHLWNSYFGGSKPSVPRPFGDAWLDGVDLFLEHGTPADRYDVLALELAKHNIRGGPGKPLHLTATVRCGYPPAAHVGRALATGIFERVHVRTYESDKWCNQNLGWEGSWDKWTAAYPATRFYVGLTADDKSHQWVHPKNVYYGVAPVAQKKDNYGGIMLWDRYFDKQTNYSSLIKYYA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	endo-1,4-xylanase
分子量 formula_weight	20634.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QSITTSQTGTNNGYYYSFWTNGGGEVTYTNGDNGEYSVTWVDCGDFTSGKGWNPANAQTVTYSGEFNPSGNAYLAVYGWTTDPLVEYYILESYGTYNPSSGLTSLGQVTSDGGTYDIYSTQRVNQPSIEGTSTFNQYWSVRTEKRVGGTVTTANHFAAWKALGLEMGTYNYMIVSTEGYESSGSSTITVS

来源 Source

来源生物 organism	Penicillium funiculosum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28572
宿主生物 host_organism	Penicillium funiculosum

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	11

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	199

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1te1a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.5 — Type II chitinase

结构域编号 domain_id	d1te1b_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.11 — Xylanase/endoglucanase 11/12

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1te1A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	1te1B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — Glycoside hydrolase family 11/12, catalytic domain

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晶胞边长 a length_a	98.748 Å
晶胞边长 b length_b	98.748 Å
晶胞边长 c length_c	112.095 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2129
R_work r_work	0.2084
R_free r_free	0.2709

Crystal structure of family 11 xylanase in complex with inhibitor (XIP-I)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

xylanase inhibitor protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

endo-1,4-xylanase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1te1__assembly_1__model_1

1te1__assembly_1__model_1 | I(q)

1te1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of family 11 xylanase in complex with inhibitor (XIP-I)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

xylanase inhibitor protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

endo-1,4-xylanase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1te1__assembly_1__model_1

1te1__assembly_1__model_1 | I(q)

1te1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)