SAXSdb — 1tjb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly	物理组成	蛋白状态	蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物	数据核对
1	蛋白单体	单体	1 / 0 / 0 / 0	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	1 / 0 / 0 / 0	与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1tjb
沉积日期 deposition_date	2004-06-03
结构标题 title	Crystal Structure of a High Affinity Lanthanide-Binding Peptide (LBT)
关键词 keywords	Lanthanide-Based Resonance Energy Transfer, Fluorescence, EF-Hand, Troponin Based Design, Lanthanide Binding Tag, DE NOVO PROTEIN; DE NOVO PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1tjb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1tjb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1tjb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	8.32 Å
Rg（电子密度）	7.28 Å
总 Rg	8.88 Å
原子数	145
残基数	17
排除体积	2523 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1tjb__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1tjb__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Lanthanide-Binding Peptide
分子量 formula_weight	1986.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	332

YIDTNNDGWYEGDELLAX

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	TERBIUM(III) ION
分子量 formula_weight	158.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	45

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1tjba_
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.44 — Designed EF-hand type cation-binding loop
超家族 Superfamily superfamily	k.44.1 — Designed EF-hand type cation-binding loop
家族 Family family	k.44.1.1 — Designed EF-hand type cation-binding loop

结构域编号 domain_id	d1tjbb_
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.44 — Designed EF-hand type cation-binding loop
超家族 Superfamily superfamily	k.44.1 — Designed EF-hand type cation-binding loop
家族 Family family	k.44.1.1 — Designed EF-hand type cation-binding loop

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晶胞边长 a length_a	52.160 Å
晶胞边长 b length_b	22.270 Å
晶胞边长 c length_c	30.030 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	103.89 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	17.180 Å
R 因子 r_factor	0.1647
R_work r_work	0.1613
R_free r_free	0.1953

Crystal Structure of a High Affinity Lanthanide-Binding Peptide (LBT)