Brucella melitensis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | water × 4 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q8YFD6_BRUME |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 B； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 |
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| 条目编号 entry_id | 1tm0 |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-06-10 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of the putative proline racemase from Brucella melitensis, Northeast Structural Genomics Target LR31 |
| 关键词 keywords | ;STRUCTURAL GENOMICS, alpha-beta protein that resembles double-beta barrel, in each of which an alpha helix is sandwiched, PSI, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG, ISOMERASE ;; ISOMERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 29.56 Å |
| Rg（电子密度） | 29.38 Å |
| 总 Rg | 29.79 Å |
| 原子数 | 4684 |
| 残基数 | 602 |
| 排除体积 | 83583 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1tm0__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 1tm0__assembly_2__model_1 |
tetrameric （4） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 3 | 1 | 1tm0__assembly_3__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 4 | 1 | 1tm0__assembly_4__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1tm0a_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.21 — Diaminopimelate epimerase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.21.1 — Diaminopimelate epimerase-like |
| 家族 Family family | d.21.1.3 — Proline racemase |
| 结构域编号 domain_id | d1tm0b_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.21 — Diaminopimelate epimerase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.21.1 — Diaminopimelate epimerase-like |
| 家族 Family family | d.21.1.3 — Proline racemase |
| 结构域编号 domain_id | 1tm0A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 310 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 1tm0A02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 310 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 1tm0B01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 310 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 1tm0B02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 310 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 |