1tu2

THE COMPLEX OF NOSTOC CYTOCHROME F AND PLASTOCYANIN DETERMIN WITH PARAMAGNETIC NMR. BASED ON THE STRUCTURES OF CYTOCHROME F AND PLASTOCYANIN, 10 STRUCTURES

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Plastocyanin

Nostoc sp.

UniProt P46444

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Apocytochrome f × 1 (Q93SW9) COPPER (II) ION × 1 HEME C × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PLAS_ANASP
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–105; UniProt 35–139

Apocytochrome f

Nostoc sp.

UniProt Q93SW9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Plastocyanin × 1 (P46444) COPPER (II) ION × 1 HEME C × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CYF_ANASP
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–254; UniProt 45–298

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1tu2
沉积日期 deposition_date2004-06-24
结构标题 titleTHE COMPLEX OF NOSTOC CYTOCHROME F AND PLASTOCYANIN DETERMIN WITH PARAMAGNETIC NMR. BASED ON THE STRUCTURES OF CYTOCHROME F AND PLASTOCYANIN, 10 STRUCTURES
关键词 keywords;ELECTRON TRANSPORT, PARAMAGNETIC, CHEMICAL SHIFT, COMPLEX FORMATION, DYNAMIC COMPLEX, PHOTOSYNTHESIS, PSEUDOCONTACT SHIFT, ELECTRON TRANSPORT PROTEINS COMPLEX ;; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1tu2__assembly_1__model_5

Assembly 1 · Model 5 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1tu2__assembly_1__model_5 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1tu2__assembly_1__model_5 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.84 Å
Rg(电子密度)24.21 Å
总 Rg24.97 Å
原子数5437
残基数359
排除体积48854 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1tu2__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1tu2__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1tu2__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1tu2__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1tu2__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1tu2__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1tu2__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1tu2__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1tu2__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1tu2__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1tu2a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.6.1 — Cupredoxins
家族 Family familyb.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like
结构域编号 domain_idd1tu2b1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamilyb.2.6 — Cytochrome f, large domain
家族 Family familyb.2.6.1 — Cytochrome f, large domain
结构域编号 domain_idd1tu2b2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamilyb.84.2 — Rudiment single hybrid motif
家族 Family familyb.84.2.2 — Cytochrome f, small domain

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1tu2A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Cupredoxins - blue copper proteins
结构域编号 domain_id1tu2B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily830 — Cytochrome f large domain
结构域编号 domain_id1tu2B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
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7. 引用文献 (3)