← 返回搜索
1u7p

X-ray Crystal Structure of the Hypothetical Phosphotyrosine Phosphatase MDP-1 of the Haloacid Dehalogenase Superfamily

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

magnesium-dependent phosphatase-1

Mus musculus

UniProt Q9D967

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 MAGNESIUM ION × 1 TUNGSTATE(VI)ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 MAGNESIUM ION × 1 TUNGSTATE(VI)ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1u7o 1u7p 1u7p 1u7p 1u7p

共 5 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9D967_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 B； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 C； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 D； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1u7p
沉积日期 deposition_date2004-08-04
结构标题 titleX-ray Crystal Structure of the Hypothetical Phosphotyrosine Phosphatase MDP-1 of the Haloacid Dehalogenase Superfamily
关键词 keywords;HAD superfamily, phosphoryl transfer, phosphotyrosine phosphatase, aspartate nucleophile, enzyme evolution, structural enzymology, class III, HYDROLASE ;; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1u7p__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1u7p__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1u7p__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）16.96 Å
Rg（电子密度）15.46 Å
总 Rg16.59 Å
原子数1297
残基数162
排除体积23023 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1u7p__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1u7p__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1u7p__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 1u7p__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1u7pa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.17 — Magnesium-dependent phosphatase-1, Mdp1
结构域编号 domain_idd1u7pb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.17 — Magnesium-dependent phosphatase-1, Mdp1
结构域编号 domain_idd1u7pc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.17 — Magnesium-dependent phosphatase-1, Mdp1
结构域编号 domain_idd1u7pd_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.17 — Magnesium-dependent phosphatase-1, Mdp1

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1u7pA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id1u7pB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id1u7pC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id1u7pD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
▶

7. 引用文献 (4)