1u9e

CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH WAY-397

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 70.2 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Estrogen receptor beta

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 261–501	未记录	STEROID RECEPTOR COACTIVATOR-1 × 1 397 2-(4-HYDROXY-PHENYL)BENZOFURAN-5-OL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG3350, Mg formate , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 261–501	未记录	STEROID RECEPTOR COACTIVATOR-1 × 1 397 2-(4-HYDROXY-PHENYL)BENZOFURAN-5-OL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG3350, Mg formate , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 261–501 链 B； UniProt 261–501	未记录	STEROID RECEPTOR COACTIVATOR-1 × 2 397 2-(4-HYDROXY-PHENYL)BENZOFURAN-5-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG3350, Mg formate , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1U9E	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1L2J Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (R,R)-5,11-cis-diethyl-5,6,11,12-tetrahydrochrysene-2,8-diol 提交 2002-02-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 256–505（250 aa）片段：ligand-binding domain (residues 256-505)	未记录	ETC (R,R)-5,11-CIS-DIETHYL-5,6,11,12-TETRAHYDROCHRYSENE-2,8-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.5-1.75 M Ammonium sulfate, 100 mM Sodium Acetate pH 4.8-5.2 294-296 K, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.299
1L2J Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (R,R)-5,11-cis-diethyl-5,6,11,12-tetrahydrochrysene-2,8-diol 提交 2002-02-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 256–505（250 aa）片段：ligand-binding domain (residues 256-505)	未记录	ETC (R,R)-5,11-CIS-DIETHYL-5,6,11,12-TETRAHYDROCHRYSENE-2,8-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.5-1.75 M Ammonium sulfate, 100 mM Sodium Acetate pH 4.8-5.2 294-296 K, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.299
1L2J Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (R,R)-5,11-cis-diethyl-5,6,11,12-tetrahydrochrysene-2,8-diol 提交 2002-02-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 256–505（250 aa）片段：ligand-binding domain (residues 256-505)	未记录	ETC (R,R)-5,11-CIS-DIETHYL-5,6,11,12-TETRAHYDROCHRYSENE-2,8-DIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.5-1.75 M Ammonium sulfate, 100 mM Sodium Acetate pH 4.8-5.2 294-296 K, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.299
1NDE Estrogen Receptor beta with Selective Triazine Modulator 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 256–501（246 aa）片段：residues 256-501	未记录	MON 4-(2-{[4-{[3-(4-CHLOROPHENYL)PROPYL]SULFANYL}-6-(1-PIPERAZINYL)-1,3,5-TRIAZIN-2-YL]AMINO}ETHYL)PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；50mM PIPES pH6.5, 200 mM lithium sulfate, 8-12% PEG35000, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K, temperature 295K	分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1NDE Estrogen Receptor beta with Selective Triazine Modulator 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 256–501（246 aa）片段：residues 256-501	未记录	MON 4-(2-{[4-{[3-(4-CHLOROPHENYL)PROPYL]SULFANYL}-6-(1-PIPERAZINYL)-1,3,5-TRIAZIN-2-YL]AMINO}ETHYL)PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；50mM PIPES pH6.5, 200 mM lithium sulfate, 8-12% PEG35000, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K, temperature 295K	分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1NDE Estrogen Receptor beta with Selective Triazine Modulator 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 256–501（246 aa）片段：residues 256-501	未记录	MON 4-(2-{[4-{[3-(4-CHLOROPHENYL)PROPYL]SULFANYL}-6-(1-PIPERAZINYL)-1,3,5-TRIAZIN-2-YL]AMINO}ETHYL)PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；50mM PIPES pH6.5, 200 mM lithium sulfate, 8-12% PEG35000, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K, temperature 295K	分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1QKM HUMAN OESTROGEN RECEPTOR BETA LIGAND-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH PARTIAL AGONIST GENISTEIN 提交 1999-07-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 255–509（255 aa）片段：LIGAND-BINDING DOMAIN	未记录	GEN GENISTEIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.1；6-9% (W/V) PEG 6000, 1.6-2.1M NACL, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.1	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
1U3Q Crystal Structure of Estrogen Receptor beta complexed with CL-272 提交 2004-07-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）链 C 261–500（240 aa）	未记录	272 4-(6-HYDROXY-BENZO[D]ISOXAZOL-3-YL)BENZENE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG2000, MgCl, hexaminecobalt trichloride, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
1U3Q Crystal Structure of Estrogen Receptor beta complexed with CL-272 提交 2004-07-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）链 D 261–500（240 aa）	未记录	272 4-(6-HYDROXY-BENZO[D]ISOXAZOL-3-YL)BENZENE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG2000, MgCl, hexaminecobalt trichloride, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
1U3R Crystal Structure of Estrogen Receptor beta complexed with WAY-338 提交 2004-07-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–501（241 aa）链 B 261–501（241 aa）	未记录	338 2-(5-HYDROXY-NAPHTHALEN-1-YL)-1,3-BENZOOXAZOL-6-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；291 K；PEG3350, Mg formate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.21 Å R-free 0.267
1U3S Crystal Structure of Estrogen Receptor beta complexed with WAY-797 提交 2004-07-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）链 B 261–500（240 aa）	未记录	797 3-(6-HYDROXY-NAPHTHALEN-2-YL)-BENZO[D]ISOOXAZOL-6-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；291 K；PEG3350, Mg formate , pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.250
1X76 CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH WAY-697 提交 2004-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）链 B 261–500（240 aa）	未记录	697 5-HYDROXY-2-(4-HYDROXYPHENYL)-1-BENZOFURAN-7-CARBONITRILE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；291 K；PEG3350, Mg Formate, pH 5.90, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.265
1X78 CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH WAY-244 提交 2004-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）链 B 261–500（240 aa）	未记录	244 [5-HYDROXY-2-(4-HYDROXYPHENYL)-1-BENZOFURAN-7-YL]ACETONITRILE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；291 K；PEG3350, Mg Formate, pH 5.90, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.270
1X7B CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH ERB-041 提交 2004-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）链 B 261–500（240 aa）	未记录	041 2-(3-FLUORO-4-HYDROXYPHENYL)-7-VINYL-1,3-BENZOXAZOL-5-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG3350, Mg Formate, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.266
1X7J CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH GENISTEIN 提交 2004-08-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）链 B 261–500（240 aa）	未记录	GEN GENISTEIN × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG2000, MgCL., pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.282
1ZAF Crystal structure of estrogen receptor beta complexed with 3-Bromo-6-hydroxy-2-(4-hydroxy-phenyl)-inden-1-one 提交 2005-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 263–500（238 aa）链 B 263–500（238 aa）	未记录	789 3-BROMO-6-HYDROXY-2-(4-HYDROXYPHENYL)-1H-INDEN-1-ONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；15% PEG3350, 0.2M Mg Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.286
2FSZ A second binding site for hydroxytamoxifen within the coactivator-binding groove of estrogen receptor beta 提交 2006-01-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 257–502（246 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 257–502（246 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S, C369S, C481S 突变：C334S, C369S, C481S	OHT 4-HYDROXYTAMOXIFEN × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；0.1M sodium citrate, 1.5M sodium chloride, 4% ethylene imine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.299
2FSZ A second binding site for hydroxytamoxifen within the coactivator-binding groove of estrogen receptor beta 提交 2006-01-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 257–502（246 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 257–502（246 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S, C369S, C481S 突变：C334S, C369S, C481S	OHT 4-HYDROXYTAMOXIFEN × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；0.1M sodium citrate, 1.5M sodium chloride, 4% ethylene imine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.299
2GIU Human estrogen receptor beta ligand-binding domain in complex with compound 45 提交 2006-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 260–500（241 aa）片段：LIGAND-BINDING DOMAIN (Residues 260-500)	未记录	FBR (9aS)-4-bromo-9a-butyl-7-hydroxy-1,2,9,9a-tetrahydro-3H-fluoren-3-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；Precipitant 1.8 M NaCl, 6% PEG 6000, 3% isopropanol, 50 mM Tris buffer pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.20 Å R-free 0.323
2I0G Benzopyrans are Selective Estrogen Receptor beta Agonists (SERBAs) with Novel Activity in Models of Benign Prostatic Hyperplasia 提交 2006-08-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 256–505（250 aa）链 B 256–505（250 aa）	未记录	I0G (3AS,4R,9BR)-4-(4-HYDROXYPHENYL)-1,2,3,3A,4,9B-HEXAHYDROCYCLOPENTA[C]CHROMEN-8-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.1M Tris, pH 8.0, 2M sodium chloride, 4% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.50 Å R-free 0.271
2JJ3 Estrogen receptor beta ligand binding domain in complex with a Benzopyran agonist 提交 2007-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 256–505（250 aa）片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, RESIDUES 256-505 链 B 256–505（250 aa）片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, RESIDUES 256-505	未记录	JJ3 (3AS,4R,9BR)-4-(4-HYDROXYPHENYL)-6-(METHOXYMETHYL)-1,2,3,3A,4,9B-HEXAHYDROCYCLOPENTA[C]CHROMEN-8-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；2M NACL, 9% PEG 6,000, 100MM TRIS PH 8.0	分辨率 2.28 Å R-free 0.255
2NV7 Crystal Structure of Estrogen Receptor Beta Complexed with WAY-555 提交 2006-11-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 263–500（238 aa）链 B 263–500（238 aa）	未记录	555 4-(4-HYDROXYPHENYL)-1-NAPHTHALDEHYDE OXIME × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；precipitant: PEG3350, Mg formate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.265
2QTU Estrogen receptor beta ligand-binding domain complexed to a benzopyran ligand 提交 2007-08-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 256–505（250 aa）片段：ligand binding domain 链 B 256–505（250 aa）片段：ligand binding domain	未记录	3AS (3aS,4R,9bR)-2,2-difluoro-4-(4-hydroxyphenyl)-6-(methoxymethyl)-1,2,3,3a,4,9b-hexahydrocyclopenta[c]chromen-8-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；0.1 M Tris-HCl, 2 M NaCl, 4% PEG 6000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.53 Å R-free 0.279
2YJD Stapled peptide bound to Estrogen Receptor Beta 提交 2011-05-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, RESIDUES 261-500 链 B 261–500（240 aa）片段：LIGAND-BINDING DOMAIN, RESIDUES 261-500	未记录	YJD 4-(2-PROPAN-2-YLOXYBENZIMIDAZOL-1-YL)PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.93 Å R-free 0.260
2YLY Sulfonamides as selective Estrogen Receptor beta Agonists. 提交 2011-06-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 260–500（241 aa）片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 260-500 链 B 260–500（241 aa）片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 260-500	未记录	SU4 N-cyclopropyl-4-oxidanyl-N-[(2R)-2-oxidanyl-2-phenyl-propyl]benzenesulfonamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å R-free 0.275
2Z4B Estrogen receptor beta ligand-binding domain complexed to a benzopyran ligand 提交 2007-06-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 256–505（250 aa）片段：ligand-binding domain (Residues 251-505) 链 B 256–505（250 aa）片段：ligand-binding domain (Residues 251-505)	未记录	DC8 (3AS,4R,9BR)-2,2-DIFLUORO-4-(4-HYDROXYPHENYL)-1,2,3,3A,4,9B-HEXAHYDROCYCLOPENTA[C]CHROMEN-8-OL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；0.1M Tris, pH 8.0, 2M sodium chloride, 4% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, temperature 289.0K	分辨率 2.34 Å R-free 0.253
3OLL Crystal structure of phosphorylated estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.50 Å R-free 0.208
3OLL Crystal structure of phosphorylated estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.50 Å R-free 0.208
3OLL Crystal structure of phosphorylated estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500) 链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EST ESTRADIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.50 Å R-free 0.208
3OLS Crystal structure of estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.20 Å R-free 0.266
3OLS Crystal structure of estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.20 Å R-free 0.266
3OLS Crystal structure of estrogen receptor beta ligand binding domain 提交 2010-08-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500) 链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	EST ESTRADIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.20 Å R-free 0.266
3OMO Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	WV7 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.21 Å R-free 0.264
3OMO Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	WV7 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.21 Å R-free 0.264
3OMO Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500) 链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	WV7 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.21 Å R-free 0.264
3OMP Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	W14 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
3OMP Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	W14 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
3OMP Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500) 链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	W14 2-(trifluoroacetyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
3OMQ Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	W23 2-[(trifluoromethyl)sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.97 Å R-free 0.260
3OMQ Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	W23 2-[(trifluoromethyl)sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.97 Å R-free 0.260
3OMQ Fragment-Based Design of novel Estrogen Receptor Ligands 提交 2010-08-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500) 链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 261-500)	未记录	W23 2-[(trifluoromethyl)sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% PEG10000 (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.97 Å R-free 0.260
4J24 Estrogen Receptor in complex with proline-flanked LXXLL peptides 提交 2013-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：;Ligand Binding Domain, UNP residue 261-500' ;	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；277 K；0.2M Magnesium acetate, 20%(w/v) PEG3350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4J24 Estrogen Receptor in complex with proline-flanked LXXLL peptides 提交 2013-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：;Ligand Binding Domain, UNP residue 261-500' ;	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；277 K；0.2M Magnesium acetate, 20%(w/v) PEG3350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4J24 Estrogen Receptor in complex with proline-flanked LXXLL peptides 提交 2013-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 261–500（240 aa）片段：;Ligand Binding Domain, UNP residue 261-500' ;	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；277 K；0.2M Magnesium acetate, 20%(w/v) PEG3350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4J24 Estrogen Receptor in complex with proline-flanked LXXLL peptides 提交 2013-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 261–500（240 aa）片段：;Ligand Binding Domain, UNP residue 261-500' ;	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；277 K；0.2M Magnesium acetate, 20%(w/v) PEG3350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
4J26 Estrogen Receptor in complex with proline-flanked LXXLL peptides 提交 2013-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain, UNP residues 261-500	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；277 K；10%-20% PEG6000, 0.6M-2M LiCl, 100mM Citric Acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.242
4J26 Estrogen Receptor in complex with proline-flanked LXXLL peptides 提交 2013-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 261–500（240 aa）片段：Ligand Binding Domain, UNP residues 261-500	未记录	EST ESTRADIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；277 K；10%-20% PEG6000, 0.6M-2M LiCl, 100mM Citric Acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.242
4ZI1 HUMAN ESTROGEN RECEPTOR BETA LIGAND-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH KB095285 AND CIA12 COACTIVATOR PEPTIDE 提交 2015-04-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 262–509（248 aa）片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP residues 262-509	未记录	KB0 2-(4-hydroxyphenyl)-7-methyl-3-phenyl-1H-inden-5-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；10.5% (W/V) P6000, 1.75M NACL 0.1 M MES, PH 5.2, 12.5% (V/V) GLYCEROL, 2 TIMES EXCESS OF CIA12 PEPTIDE	分辨率 2.10 Å R-free 0.223
5TOA Crystal Structure of ER beta bound to Estradiol 提交 2016-10-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 262–509（248 aa）片段：UNP residues 262-509 链 B 262–509（248 aa）片段：UNP residues 262-509	未记录	EST ESTRADIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.1 M Na-citrate, 10% [w/v] PEG-4000, 10% [v/v] isopropanol	分辨率 2.50 Å R-free 0.244
7XVY Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with S-DPN 提交 2022-05-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S, C369S, C481S 突变：C334S, C369S, C481S	I0K (2~{S})-2,3-bis(4-hydroxyphenyl)propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16-20% PEG3350, 100 mM BisTris pH6.5, 200 mM Magnesium Acetate	分辨率 1.54 Å R-free 0.237
7XVZ Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (R)-3-(2-chloro-4-hydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile 提交 2022-05-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S,C369S,C481S 突变：C334S,C369S,C481S	I1D (2~{R})-3-(2-chloranyl-4-oxidanyl-phenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16-20% PEG3350, 100 mM BisTris pH6.5, 200 mM Magnesium Acetate	分辨率 2.08 Å R-free 0.307
7XWP Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (S)-3-(2-chloro-4-hydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile 提交 2022-05-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S,C369S,C481S 突变：C334S,C369S,C481S	I1I (2~{S})-3-(2-chloranyl-4-oxidanyl-phenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16-20% PEG3350, 100 mM BisTris pH6.5, 200 mM Magnesium Acetate	分辨率 1.92 Å R-free 0.255
7XWQ Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (R)-2-(2-chloro-4-hydroxyphenyl)-3-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile 提交 2022-05-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S,C369S,C481S 突变：C334S,C369S,C481S	I1M (2~{R})-2-(2-chloranyl-4-oxidanyl-phenyl)-3-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16-20% PEG3350, 100 mM BisTris pH6.5, 200 mM Magnesium Acetate	分辨率 1.89 Å R-free 0.239
7XWR Human Estrogen Receptor beta Ligand-binding Domain in Complex with (S)-2-(2-chloro-4-hydroxyphenyl)-3-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile 提交 2022-05-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain 链 B 261–500（240 aa）片段：ligand-binding domain	突变：C334S,C369S,C481S 突变：C334S,C369S,C481S	I2B (2~{S})-2-(2-chloranyl-4-oxidanyl-phenyl)-3-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；16-20% PEG3350, 100 mM BisTris pH6.5, 200 mM Magnesium Acetate	分辨率 2.16 Å R-free 0.318
9EBL Crystal structure of the hERbeta LBD complexed with androstenediol and SRC 2-2 peptide (crystal form 1) 提交 2024-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octameric	链 A 262–500（239 aa）链 B 262–500（239 aa）链 E 262–500（239 aa）链 F 262–500（239 aa）	未记录	B81 (3alpha,8alpha,17beta)-androst-5-ene-3,17-diol × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M sodium HEPES pH 7.5, 22% w/v PEG 5000 MME	分辨率 2.20 Å R-free 0.277
9ECF Crystal structure of the hERbeta LBD complexed with androstenediol and SRC 2-2 peptide (crystal form 2) 提交 2024-11-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 261–500（240 aa）链 F 261–500（240 aa）	未记录	B81 (3alpha,8alpha,17beta)-androst-5-ene-3,17-diol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.278
9ECF Crystal structure of the hERbeta LBD complexed with androstenediol and SRC 2-2 peptide (crystal form 2) 提交 2024-11-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–500（240 aa）链 B 261–500（240 aa）	未记录	B81 (3alpha,8alpha,17beta)-androst-5-ene-3,17-diol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.278
9ECF Crystal structure of the hERbeta LBD complexed with androstenediol and SRC 2-2 peptide (crystal form 2) 提交 2024-11-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 261–500（240 aa）链 J 261–500（240 aa）	未记录	B81 (3alpha,8alpha,17beta)-androst-5-ene-3,17-diol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.278
9ECF Crystal structure of the hERbeta LBD complexed with androstenediol and SRC 2-2 peptide (crystal form 2) 提交 2024-11-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 261–500（240 aa）链 N 261–500（240 aa）	未记录	B81 (3alpha,8alpha,17beta)-androst-5-ene-3,17-diol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.278

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UniProt名称	ESR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–241； UniProt 261–501 作者链 B； PDB构建体 1–241； UniProt 261–501

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1u9e
沉积日期 deposition_date	2004-08-09
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH WAY-397
关键词 keywords	ESTROGEN RECEPTOR, ESTROGEN RECEPTOR BETA, ER-BETA, ER, ESTROGEN, NUCLEAR RECEPTOR, TRANSCRIPTION FACTOR, AGONIST, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	23.22 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.25 Å
零角强度 I(0) i0	43105300.00
分子量 molecular_weight	53576.0 kDa
排除体积 excluded_volume	68351 Å³
包络体积 envelope_volume	79234 Å³
水化壳体积 shell_volume	28678 Å³
包络直径 envelope_diameter	73.1 Å
壳层 Rg shell_rg	29.90 Å
包络 Rg envelope_rg	22.31 Å
形状 Rg shape_rg	22.27 Å
总 Rg total_rg	23.09 Å
总原子数 total_atoms	3741
残基数 n_residues	469
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	70.2 Å
Rg (实空间) rg_real	23.05 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.34 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.3110e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.0140e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	23.09 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	43110000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9067
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	29.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.106
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.530
角度范围 angular_range	— – 0.3400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	16470000.0000
实空间数据点数 n_real_points	66
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.935; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.999

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Estrogen receptor beta
分子量 formula_weight	27266.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3848

DALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	STEROID RECEPTOR COACTIVATOR-1
分子量 formula_weight	1017.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

KLVQLLTTT

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-(4-HYDROXY-PHENYL)BENZOFURAN-5-OL
分子量 formula_weight	226.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	107

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1u9ea_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
家族 Family family	a.123.1.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	d1u9eb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
家族 Family family	a.123.1.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1u9eA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Retinoid X Receptor

结构域编号 domain_id	1u9eB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Retinoid X Receptor

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	52.113 Å
晶胞边长 b length_b	87.935 Å
晶胞边长 c length_c	99.524 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	19.850 Å
R 因子 r_factor	0.2340
R_work r_work	0.2310
R_free r_free	0.2790

fit	/app/data/saxs_computation/u9/1u9e/1u9e.fit
pddf	/app/data/pr_computation/u9/1u9e/1u9e.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/u9/1u9e/1u9e.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF ESTROGEN RECEPTOR BETA COMPLEXED WITH WAY-397

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Estrogen receptor beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)