Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | ;RNA (5'-R (GP*GP*CP*UP*GP*GP*AP*CP*UP*CP*GP*UP*AP*CP*UP*UP*CP*GP* GP*UP*AP*CP*UP*GP*GP*AP*GP*AP*AP*AP*CP*AP*GP*CP*C)-3') ; × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | REV_HV1W2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–17； UniProt 8–24 |
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| 条目编号 entry_id | 1ull |
| 沉积日期 deposition_date | 1996-11-05 |
| 结构标题 title | RNA APTAMER COMPLEXED WITH HIV-1 REV PEPTIDE, NMR, 7 STRUCTURES |
| 关键词 keywords | ;REV PEPTIDE-RNA RECOGNITION, ALPHA-HELIX IN WIDENED RNA MAJOR GROOVE, PURINE-PURINE MISMATCHES, UAU BASE TRIPLE, ADAPTIVE BINDING OF PEPTIDE AND RNA IN COMPLEX, COMPLEX (RNA APTAMER-REV PEPTIDE), Viral protein-RNA COMPLEX ;; Viral protein/RNA |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.37 Å |
| Rg（电子密度） | 14.76 Å |
| 总 Rg | 15.52 Å |
| 原子数 | 1472 |
| 残基数 | 52 |
| 排除体积 | 13392 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1ull__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 1ull__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 1ull__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 1ull__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 1ull__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 1ull__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 1ull__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d1ullb_ |
| 类 Class class | j — Peptides |
| 折叠类型 Fold fold | j.9 — Arg-rich RNA binding peptides |
| 超家族 Superfamily superfamily | j.9.2 — HIV-1 REV fragments |
| 家族 Family family | j.9.2.1 — HIV-1 REV fragments |