SAXSdb — 1usx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ-NEURAMINIDASE GLYCOPROTEIN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	同源多聚体	蛋白 2 其他聚合物 2	N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-methyl 6-thio-beta-D-galactopyranoside × 2 2-DEOXY-2,3-DEHYDRO-N-ACETYL-NEURAMINIC ACID × 2	与蛋白数一致
2	其他组合	同源多聚体	蛋白 2 其他聚合物 2	N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-methyl 6-thio-beta-D-galactopyranoside × 2 2-DEOXY-2,3-DEHYDRO-N-ACETYL-NEURAMINIC ACID × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HEMA_NDVB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–454； UniProt 124–577 作者链 B； PDB构建体 1–454； UniProt 124–577 作者链 C； PDB构建体 1–454； UniProt 124–577

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1usx
沉积日期 deposition_date	2003-12-01
结构标题 title	Crystal structure of the Newcastle disease virus hemagglutinin-neuraminidase complexed with thiosialoside
关键词 keywords	HYDROLASE, NEURAMINIDASE, HEMAGGLUTININ, SIALIDASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1usx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1usx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1usx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.61 Å
Rg（电子密度）	29.91 Å
总 Rg	30.53 Å
原子数	6998
残基数	894
排除体积	123840 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1usx__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1usx__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HEMAGGLUTININ-NEURAMINIDASE GLYCOPROTEIN
分子量 formula_weight	49856.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.18
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	10497

GAPIHDPDFIGGIGKELIVDNASDVTSFYPSAFQEHLNFIPAPTTGSGCTRIPSFDMSATHYCYTHNVILSGCRDHSHSHQYLALGVLRTTATGRIFFSTLRSISLDDTQNRKSCSVSATPLGCDMLCSKVTETEEEDYNSAVPTLMAHGRLGFDGQYHEKDLDVTTLFEDWVANYPGVGGGSFIDGRVWFSVYGGLKPNSPSDTVQEGKYVIYKRYNDTCPDEQDYQIRMAKSSYKPGRFGGKRIQQAILSIKVSTSLGEDPVLTVPPNTVTLMGAEGRILTVGTSHFLYQRGSSYFSPALLYPMTVSNKTATLHSPYTFNAFTRPGSIPCQASARCPNSCVTGVYTDPYPLIFYRNHTLRGVFGTMLDSEQARLNPASAVFDSTSRSRITRVSSSSTKAAYTTSTCFKVVKTNKTYCLSIAEISNTLFGEFRIVPLLVEILKNDGVREARSG

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-methyl 6-thio-beta-D-galactopyranoside
分子量 formula_weight	501.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-DEOXY-2,3-DEHYDRO-N-ACETYL-NEURAMINIC ACID
分子量 formula_weight	291.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1usxa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.68 — 6-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.68.1 — Sialidases
家族 Family family	b.68.1.1 — Sialidases (neuraminidases)

结构域编号 domain_id	d1usxb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.68 — 6-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.68.1 — Sialidases
家族 Family family	b.68.1.1 — Sialidases (neuraminidases)

结构域编号 domain_id	d1usxc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.68 — 6-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.68.1 — Sialidases
家族 Family family	b.68.1.1 — Sialidases (neuraminidases)

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1usxA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	120 — 6 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Neuraminidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1usxB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	120 — 6 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Neuraminidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1usxC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	120 — 6 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Neuraminidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	115.070 Å
晶胞边长 b length_b	115.070 Å
晶胞边长 c length_c	283.960 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	12.000 Å
R 因子 r_factor	0.2250
R_work r_work	0.2250
R_free r_free	0.2890

Crystal structure of the Newcastle disease virus hemagglutinin-neuraminidase complexed with thiosialoside

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ-NEURAMINIDASE GLYCOPROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1usx__assembly_1__model_1

1usx__assembly_1__model_1 | I(q)

1usx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (3)

Crystal structure of the Newcastle disease virus hemagglutinin-neuraminidase complexed with thiosialoside

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ-NEURAMINIDASE GLYCOPROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1usx__assembly_1__model_1

1usx__assembly_1__model_1 | I(q)

1usx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (3)