FIBER PROTEIN
HUMAN ADENOVIRUS TYPE 37
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 3 其他聚合物 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 172–365 链 B; UniProt 172–365 链 C; UniProt 172–365 | 片段:HEAD DOMAIN, RESIDUES 172-365 突变:YES | N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose × 2 N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-beta-D-galactopyranose × 1 ZN ZINC ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;RESERVOIR: 24 % PEG8000, 50 MM ZINC ACETATE, 100 MM HEPES, PROTEIN: 30 MM TRIS-HCL, PH 7.5, 150 MM NACL | 分辨率 1.50 Å R-free 0.205 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1UXA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1UXE ADENOVIRUS AD37 FIBRE HEAD 提交 2004-02-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
172–365(194 aa)
片段:HEAD DOMAIN RESIDUES 172-365
链 B
172–365(194 aa)
片段:HEAD DOMAIN RESIDUES 172-365
链 C
172–365(194 aa)
片段:HEAD DOMAIN RESIDUES 172-365
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES | ZN ZINC ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;RESERVOIR: 24 % PEG8000, 50 MM ZINC ACETATE, 100 MM HEPES, PH 7.5 PROTEIN: 30 MM TRIS-HCL, PH 7.5, 150 MM NACL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 2J12 Ad37 fibre head in complex with CAR D1 提交 2006-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å R-free 0.169 |
| 2WGT Structure of human adenovirus serotype 37 fibre head in complex with a sialic acid derivative, O-Methyl 5-N-propaonyl-3,5-dideoxy-D- glycero-a-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid 提交 2009-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
|
未记录 | 18D 3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
25-27 % POLYETHYLENE GLYCOL 8000, 50 MM ZINC ACETATE, AND 100 MM HEPES PH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.226 |
| 2WGU Structure of human adenovirus serotype 37 fibre head in complex with a sialic acid derivative, O-Methyl 5-N- methoxycarbonyl -3,5-dideoxy- D-glycero-a-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid 提交 2009-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365
|
未记录 | 42D 3,5-dideoxy-5-[(methoxycarbonyl)amino]-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;25-27 % POLYETHYLENE GLYCOL 8000, 50 MM ZINC ACETATE, AND 100 MM HEPES PH7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 3N0I Crystal Structure of Ad37 fiber knob in complex with GD1a oligosaccharide 提交 2010-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;293 K;26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1M HEPES, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.187 |
| 3QND crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor 提交 2011-02-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1 M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 3QND crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor 提交 2011-02-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 F
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 G
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1 M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 3QND crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor 提交 2011-02-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 E
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 F
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 G
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1 M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 4K6T Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0385 提交 2013-04-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 B
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 C
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
|
未记录 | SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 ZN ZINC ION × 7 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 1P0 2,2',2''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]triethanol × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;24% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.200 |
| 4K6T Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0385 提交 2013-04-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 F
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 G
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
|
未记录 | SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 ZN ZINC ION × 7 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;24% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.200 |
| 4K6U Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0386 提交 2013-04-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 B
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 C
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 1P4 3,3',3''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]tripropan-1-ol × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;293 K;26% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 4K6V Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0407 提交 2013-04-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 B
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 C
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 18D 3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 1P4 3,3',3''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]tripropan-1-ol × 1 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;293 K;25% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.185 |
| 4K6W Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0408 提交 2013-04-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 B
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
链 C
177–365(189 aa)
片段:fiber knob
|
未记录 | 18D 3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 1P0 2,2',2''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]triethanol × 1 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.1;293 K;28% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.167 |
| 4XQA CRYSTAL STRUCTURE OF AD37 FIBER KNOB IN COMPLEX WITH TRIVALENT SIALIC ACID INHIBITOR ME0462 提交 2015-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 ZN ZINC ION × 3 423 (1-{2-[bis(2-{4-[({(6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranonosyl}oxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethyl)amino]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl (6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranosidonic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;26% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.172 |
| 4XQB CRYSTAL STRUCTURE OF AD37 FIBER KNOB IN COMPLEX WITH TRIVALENT SIALIC ACID INHIBITOR ME0461 提交 2015-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 B
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
链 C
177–365(189 aa)
片段:UNP residues 177-365
|
未记录 | 425 2-(1-{2-[bis(2-{4-[2-({(6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranonosyl}oxy)ethyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethyl)amino]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)ethyl (6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranosidonic acid × 1 ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;28% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.178 |
| 9FAH Human adenovirus type 37 fiber knob in complex with 4-O,5-N-diacetylneuraminic acid 提交 2024-05-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–365(365 aa)
链 B
1–365(365 aa)
链 C
1–365(365 aa)
|
未记录 | ANA methyl 4-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 3 ZN ZINC ION × 5 ACT ACETATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;26% PEG 8000, 0.1 M HEPES pH 6.9, 0.05 M zinc acetate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.190 |
共 13 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | Q64823 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–194; UniProt 172–365 作者链 B; PDB构建体 1–194; UniProt 172–365 作者链 C; PDB构建体 1–194; UniProt 172–365 |