1v06

AXH domain of the transcription factor HBP1 from M.musculus

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HMG BOX-CONTAINING PROTEIN 1

MUS MUSCULUS

UniProt Q8R316

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8R316
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–142; UniProt 208–345

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1v06
沉积日期 deposition_date2004-03-24
结构标题 titleAXH domain of the transcription factor HBP1 from M.musculus
关键词 keywords;DNA-BINDING PROTEIN, TRANSCRIPTION FACTOR, PROTEIN-PROTEIN INTERACTION, NUCLEIC ACID BINDING, OB-FOLD, ATAXIN-1 HOMOLOGOUS, REPRESSOR, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION REGULATION, WNT SIGNALING PATHWAY, DNA BINDING PROTEIN ;; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1v06__assembly_1__model_12

Assembly 1 · Model 12 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1v06__assembly_1__model_12 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1v06__assembly_1__model_12 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)15.89 Å
Rg(电子密度)14.56 Å
总 Rg15.79 Å
原子数2118
残基数138
排除体积19131 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1v06__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1v06__assembly_1__model_2 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1v06__assembly_1__model_3 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1v06__assembly_1__model_4 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1v06__assembly_1__model_5 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1v06__assembly_1__model_6 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1v06__assembly_1__model_7 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1v06__assembly_1__model_8 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1v06__assembly_1__model_9 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1v06__assembly_1__model_10 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1v06__assembly_1__model_11 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1v06__assembly_1__model_12 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1v06__assembly_1__model_13 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1v06__assembly_1__model_14 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1v06__assembly_1__model_15 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 1v06__assembly_1__model_16 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 1v06__assembly_1__model_17 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 1v06__assembly_1__model_18 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 1v06__assembly_1__model_19 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 1v06__assembly_1__model_20 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1v06a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.145 — AXH domain
超家族 Superfamily superfamilyb.145.1 — AXH domain
家族 Family familyb.145.1.0 — automated matches
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7. 引用文献 (3)