SAXSdb — 1v6q

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly	物理组成	蛋白状态	蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	6 / 0 / 0 / 0	与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1v6q
沉积日期 deposition_date	2003-12-03
结构标题 title	Crystal Structures of Collagen Model Peptides with Pro-Hyp-Gly Sequence at 1.3 A
关键词 keywords	Collagen, Triple-helix, Model peptide, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1v6q__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1v6q__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1v6q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	12.28 Å
Rg（电子密度）	12.22 Å
总 Rg	13.10 Å
原子数	266
残基数	28
排除体积	4685 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1v6q__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Collagen like peptide
分子量 formula_weight	609.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	175

GPPGPPG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Collagen like peptide
分子量 formula_weight	665.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

PGPPGPP

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Collagen like peptide
分子量 formula_weight	649.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

PPGPPGP

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	42

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1v6qa1
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.3 — Collagen-like peptides
超家族 Superfamily superfamily	k.3.1 — Collagen-like peptides
家族 Family family	k.3.1.1 — Collagen-like peptides

结构域编号 domain_id	d1v6qa2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1v6qb_
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.3 — Collagen-like peptides
超家族 Superfamily superfamily	k.3.1 — Collagen-like peptides
家族 Family family	k.3.1.1 — Collagen-like peptides

结构域编号 domain_id	d1v6qc_
类 Class class	k — Designed proteins
折叠类型 Fold fold	k.3 — Collagen-like peptides
超家族 Superfamily superfamily	k.3.1 — Collagen-like peptides
家族 Family family	k.3.1.1 — Collagen-like peptides

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晶胞边长 a length_a	14.051 Å
晶胞边长 b length_b	26.775 Å
晶胞边长 c length_c	20.004 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	106.76 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.250 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1346
R_free r_free	0.1886

Crystal Structures of Collagen Model Peptides with Pro-Hyp-Gly Sequence at 1.3 A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目的 assembly 组成

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1v6q__assembly_1__model_1

1v6q__assembly_1__model_1 | I(q)

1v6q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

7. 引用文献 (1)