1v7l

Structure of 3-isopropylmalate isomerase small subunit from Pyrococcus horikoshii

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

3-isopropylmalate dehydratase small subunit

Pyrococcus horikoshii

UniProt O59393

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 8 water × 8 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LEUD_PYRHO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 B; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1v7l
沉积日期 deposition_date2003-12-18
结构标题 titleStructure of 3-isopropylmalate isomerase small subunit from Pyrococcus horikoshii
关键词 keywordsBETA BARREL, LYASE; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1v7l__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1v7l__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1v7l__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)33.42 Å
Rg(电子密度)32.46 Å
总 Rg33.12 Å
原子数10112
残基数1300
排除体积181830 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1v7l__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1v7l__assembly_2__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1v7l__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 1v7l__assembly_4__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1v7la_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.8 — The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
超家族 Superfamily superfamilyc.8.2 — LeuD/IlvD-like
家族 Family familyc.8.2.1 — LeuD-like
结构域编号 domain_idd1v7lb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.8 — The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
超家族 Superfamily superfamilyc.8.2 — LeuD/IlvD-like
家族 Family familyc.8.2.1 — LeuD-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1v7lA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology19 — Aconitase; domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aconitase, domain 4
结构域编号 domain_id1v7lB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology19 — Aconitase; domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aconitase, domain 4
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7. 引用文献 (1)