pectate lyase 47
Bacillus sp. TS-47
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CALCIUM ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | Q9AJM4_9BACI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–416； UniProt 26–441 |
1vbl
Structure of the thermostable pectate lyase PL 47
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1vbl |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-02-27 |
| 结构标题 title | Structure of the thermostable pectate lyase PL 47 |
| 关键词 keywords | Pectate lyase, PL 47, thermostable, Bacillus subtilis, Pectin, Calcium ion, LYASE; LYASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1vbl__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1vbl__assembly_1__model_1 | I(q)
1vbl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 22.22 Å |
| Rg（电子密度） | 21.26 Å |
| 总 Rg | 22.13 Å |
| 原子数 | 3352 |
| 残基数 | 416 |
| 排除体积 | 58949 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1vbla_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.80 — Single-stranded right-handed beta-helix |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.80.1 — Pectin lyase-like |
| 家族 Family family | b.80.1.0 — automated matches |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1vblA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 160 — 3 Solenoid |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Pectate Lyase C-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Single-stranded right-handed beta-helix, Pectin lyase-like |