1vz7

Ornithine Acetyltransferase (ORF6 Gene Product - Clavulanic Acid Biosynthesis) from Streptomyces clavuligerus

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ORNITHINE ACETYL-TRANSFERASE

STREPTOMYCES CLAVULIGERUS

UniProt Q53940

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SULFATE ION × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SULFATE ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GNA2_STRCL
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–393; UniProt 1–393 作者链 B; PDB构建体 1–393; UniProt 1–393 作者链 C; PDB构建体 1–393; UniProt 1–393 作者链 D; PDB构建体 1–393; UniProt 1–393

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1vz7
沉积日期 deposition_date2004-05-14
结构标题 titleOrnithine Acetyltransferase (ORF6 Gene Product - Clavulanic Acid Biosynthesis) from Streptomyces clavuligerus
关键词 keywordsTRANSFERASE, ORNITHINE ACETYLTRANSFERASE, CLAVULANIC ACID, N-ACETYL- ORNITHINE, N-ACETYL-GLUTAMATE, ANTIBIOTIC; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1vz7__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1vz7__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1vz7__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)28.27 Å
Rg(电子密度)27.68 Å
总 Rg28.22 Å
原子数5240
残基数733
排除体积92557 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1vz7__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1vz7__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1vz7a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.154 — DmpA/ArgJ-like
超家族 Superfamily superfamilyd.154.1 — DmpA/ArgJ-like
家族 Family familyd.154.1.2 — ArgJ-like
结构域编号 domain_idd1vz7b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.154 — DmpA/ArgJ-like
超家族 Superfamily superfamilyd.154.1 — DmpA/ArgJ-like
家族 Family familyd.154.1.2 — ArgJ-like
结构域编号 domain_idd1vz7c_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.154 — DmpA/ArgJ-like
超家族 Superfamily superfamilyd.154.1 — DmpA/ArgJ-like
家族 Family familyd.154.1.2 — ArgJ-like
结构域编号 domain_idd1vz7d_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.154 — DmpA/ArgJ-like
超家族 Superfamily superfamilyd.154.1 — DmpA/ArgJ-like
家族 Family familyd.154.1.2 — ArgJ-like

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1vz7A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
结构域编号 domain_id1vz7A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily340 — ArgJ beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id1vz7B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
结构域编号 domain_id1vz7B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily340 — ArgJ beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id1vz7C01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
结构域编号 domain_id1vz7C02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily340 — ArgJ beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id1vz7D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — L-amino peptidase D-ALA esterase/amidase
结构域编号 domain_id1vz7D02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily340 — ArgJ beta chain, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)