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1wpd

Evidence for domain-specific recognition of SK and Kv channels by MTX and HsTx1 scorpion toxins

Method: SOLUTION NMR Dmax: 31.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium channel toxin alpha-KTx 6.2,Potassium channel toxin alpha-KTx 6.3

Heterometrus spinifer

UniProt P59867

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 21–34 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1WPD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1QUZ Solution structure of the potassium channel scorpion toxin HSTX1 提交 1999-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4；308 K；压力 1
NMR样品组成 5 MG HSTX1; TSP; HCL FOR PH
NMR样品组成 5 MG HSTX1; TSP; DCL FOR PD
分辨率未提供
1Y2P Solution structure of Hstx3P 提交 2004-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3；300 K；压力 ambient
NMR测量条件 pH 3；296 K；压力 ambient
NMR样品组成 2Mm hstx3P, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KAX63_HETSP
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 21–34； UniProt 21–34

Potassium channel toxin alpha-KTx 6.2,Potassium channel toxin alpha-KTx 6.3

Heterometrus spinifer

UniProt P80719

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–20 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1WPD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1TXM SCORPION TOXIN (MAUROTOXIN) FROM SCORPIO MAURUS, NMR, 35 STRUCTURES 提交 1996-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3；290 K
分辨率未提供
1WT7 Solution structure of BuTX-MTX: a butantoxin-maurotoxin chimera 提交 2004-11-16 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–34（32 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3；290 K；压力 ambient
分辨率未提供

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KAX62_SCOPA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–20； UniProt 1–20

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1wpd

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1wpd
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1wpd
沉积日期 deposition_date2004-09-01
结构标题 titleEvidence for domain-specific recognition of SK and Kv channels by MTX and HsTx1 scorpion toxins
关键词 keywordsNeurotoxin, chimera, TOXIN; TOXIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier8.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron9.15 Å
零角强度 I(0) i0112639000.00
分子量 molecular_weight76011.0 kDa
排除体积 excluded_volume90301 ų
包络体积 envelope_volume9905 ų
水化壳体积 shell_volume8072 ų
包络直径 envelope_diameter35.1 Å
壳层 Rg shell_rg16.10 Å
包络 Rg envelope_rg11.04 Å
形状 Rg shape_rg9.14 Å
总 Rg total_rg9.38 Å
总原子数 total_atoms10120
残基数 n_residues680
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax31.8 Å
Rg (实空间) rg_real8.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.34 Å
I(0) (实空间) i0_real1.1260e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1940e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal8.85 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal112600000.0000
解质量估计 total_estimate0.7652
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary10.9 Å
偏度 Skewness skewness0.408
峰度 Kurtosis kurtosis0.082
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha25410.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.683; Stabil: 0.994; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.913; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1wpda_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.3 — Knottins (small inhibitors, toxins, lectins)
超家族 Superfamily superfamilyg.3.7 — Scorpion toxin-like
家族 Family familyg.3.7.2 — Short-chain scorpion toxins
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)