1xvb

soluble methane monooxygenase hydroxylase: 6-bromohexanol soaked structure

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 128.0 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methane monooxygenase component A alpha chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–527 链 B； UniProt 1–527	未记录	Methane monooxygenase component A beta chain × 2 Methane monooxygenase component A gamma chain × 2 （P11987） FE FE (III) ION × 4 BHL 6-BROMOHEXAN-1-OL × 10 BBU 1-BROMOBUTANE × 1 BBX 1-BROMOETHANE × 1 CA CALCIUM ION × 1 3BR 1-BROMOPROPANE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.251

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1XVB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FYZ METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II REDUCED BY SOAKING 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 2.15 Å R-free 0.230
1FZ0 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II MIXED-VALENT GROWN ANAEROBICALLY 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.07 Å R-free 0.230
1FZ1 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III OXIDIZED 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.96 Å R-free 0.234
1FZ2 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II MIXED-VALENT GENERATED BY CRYSTAL SOAKING 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.15 Å R-free 0.229
1FZ3 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAK AT PH 6.2 (0.1 M PIPES) 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.03 Å R-free 0.228
1FZ4 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAKED AT PH 8.5 (0.1 M TRIS) 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 2.38 Å R-free 0.256
1FZ5 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II CRYSTALLIZED ANAEROBICALLY FROM REDUCED ENZYME 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 2.40 Å R-free 0.253
1FZ6 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II SOAKED IN 1 M METHANOL 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 MOH METHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.05 Å R-free 0.244
1FZ7 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAKED IN 0.9 M ETHANOL 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1 EOH ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 1.96 Å R-free 0.255
1FZ8 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II COCRYSTALLIZED WITH DIBROMOMETHANE 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 2BM DIBROMOMETHANE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, dibromomethane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
1FZ9 Methane monooxygenase hydroxylase, form II cocrystallized with iodoethane 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 ETI IODOETHANE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, iodoethane. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
1FZH METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II PRESSURIZED WITH XENON GAS 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 XE XENON × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
1FZI METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM I PRESSURIZED WITH XENON GAS 提交 2000-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）链 B 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 XE XENON × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 4000, ammonium acetate, Li2SO4, MOPS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.253
1MMO CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL NON-HAEM IRON HYDROXYLASE THAT CATALYSES THE BIOLOGICAL OXIDATION OF METHANE 提交 1994-02-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 15–526（512 aa）链 E 15–526（512 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1MTY METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE FROM METHYLOCOCCUS CAPSULATUS (BATH) 提交 1996-07-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 15–526（512 aa）链 E 15–526（512 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；25 MM LI2SO4, 50 MM NH4OAC, 5% PEG 4000, IN 25 MM MOPS PH 7.0 WITH A RESERVOIR OF 20% PEG 4000	分辨率 1.70 Å
1XMF Structure of Mn(II)-Soaked Apo Methane Monooxygenase Hydroxylase Crystals from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, CaCl2, PEG8000, glycerol, azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.32 Å R-free 0.263
1XMG Crystal structure of apo methane monooxygenase hydroxylase from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；MOPS, PEG 8000, calcium chloride, glycerol, azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.10 Å R-free 0.261
1XMH Structure of Co(II) reconstituted methane monooxygenase hydroxylase from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	CO COBALT (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；MOPS, PEG 8000, calcium chloride, sodium azide, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.32 Å R-free 0.225
1XPO Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic bicyclomycin 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, FOS-choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 3.15 Å R-free 0.306
1XPO Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic bicyclomycin 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 BCM BICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, FOS-choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 3.15 Å R-free 0.306
1XPO Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic bicyclomycin 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 C 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 BCM BICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, FOS-choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 3.15 Å R-free 0.306
1XPO Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic bicyclomycin 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 D 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 BCM BICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, FOS-choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 3.15 Å R-free 0.306
1XPO Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic bicyclomycin 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 E 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 BCM BICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, FOS-choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 3.15 Å R-free 0.306
1XPO Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic bicyclomycin 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 F 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 BCM BICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, FOS-choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 3.15 Å R-free 0.306
1XPR Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-formylbicyclomycin (FB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 3350, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, Na DihydrogenPhosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.296
1XPR Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-formylbicyclomycin (FB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FB 5A-FORMYLBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 3350, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, Na DihydrogenPhosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.296
1XPR Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-formylbicyclomycin (FB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 C 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FB 5A-FORMYLBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 3350, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, Na DihydrogenPhosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.296
1XPR Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-formylbicyclomycin (FB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 D 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FB 5A-FORMYLBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 3350, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, Na DihydrogenPhosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.296
1XPR Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-formylbicyclomycin (FB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 E 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FB 5A-FORMYLBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 3350, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, Na DihydrogenPhosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.296
1XPR Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-formylbicyclomycin (FB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 F 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FB 5A-FORMYLBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 3350, Na Cacodylate, NaCl, glycerol, Na DihydrogenPhosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.296
1XPU Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-(3-formylphenylsulfanyl)-dihydrobicyclomycin (FPDB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, Glycerol, FOS-Choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.295
1XPU Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-(3-formylphenylsulfanyl)-dihydrobicyclomycin (FPDB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FPD 5A-(3-FORMYLPHENYLSULFANYL)-DIHYDROBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, Glycerol, FOS-Choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.295
1XPU Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-(3-formylphenylsulfanyl)-dihydrobicyclomycin (FPDB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 C 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FPD 5A-(3-FORMYLPHENYLSULFANYL)-DIHYDROBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, Glycerol, FOS-Choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.295
1XPU Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-(3-formylphenylsulfanyl)-dihydrobicyclomycin (FPDB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 D 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 FPD 5A-(3-FORMYLPHENYLSULFANYL)-DIHYDROBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, Glycerol, FOS-Choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.295
1XPU Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-(3-formylphenylsulfanyl)-dihydrobicyclomycin (FPDB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 E 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 FPD 5A-(3-FORMYLPHENYLSULFANYL)-DIHYDROBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, Glycerol, FOS-Choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.295
1XPU Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by the antibiotic 5a-(3-formylphenylsulfanyl)-dihydrobicyclomycin (FPDB) 提交 2004-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 F 1–419（419 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 FPD 5A-(3-FORMYLPHENYLSULFANYL)-DIHYDROBICYCLOMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Na Cacodylate, NaCl, Glycerol, FOS-Choline-12, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.295
1XU3 Soluble methane monooxygenase hydroxylase-soaked with bromophenol 提交 2004-10-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 BML 4-BROMOPHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, pH 7.00	分辨率 2.30 Å R-free 0.245
1XU5 Soluble methane monooxygenase hydroxylase-phenol soaked 提交 2004-10-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 OH HYDROXIDE ION × 2 IPH PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.96 Å R-free 0.228
1XVC soluble methane monooxygenase hydroxylase: 8-bromooctanol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 BR BROMIDE ION × 2 5BR 1-BROMOPENTANE × 1 BMM BROMOMETHANE × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
1XVD Soluble methane monooxygenase hydroxylase: 4-fluorophenol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 FPN 4-FLUOROPHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, CaCl2, NaN3, glyerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 2.30 Å R-free 0.229
1XVE soluble methane monooxygenase hydroxylase: 3-bromo-3-butenol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 3BB 3-BROMOBUT-3-EN-1-OL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.260
1XVF soluble methane monooxygenase hydroxylase: chloropropanol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 3CL 3-CHLOROPROPANOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
1XVG soluble methane monooxygenase hydroxylase: bromoethanol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–527（527 aa）片段：alpha subunit 链 B 1–527（527 aa）片段：alpha subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 BRJ 2-BROMOETHANOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, CaCl2, NaN3, glyerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.96 Å R-free 0.230
4GAM Complex structure of Methane monooxygenase hydroxylase and regulatory subunit 提交 2012-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–527（527 aa）链 F 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES and 15% PEG 20,000 (w/v) ure 298K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.90 Å R-free 0.258
4GAM Complex structure of Methane monooxygenase hydroxylase and regulatory subunit 提交 2012-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 K 1–527（527 aa）链 P 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES and 15% PEG 20,000 (w/v) ure 298K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.90 Å R-free 0.258
7TC7 Cryo-EM structure of methane monooxygenase hydroxylase (by quantifoil) 提交 2021-12-23	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–527（527 aa）链 E 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；30 mM HEPES, pH 7, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7TC8 Cryo-EM structure of methane monooxygenase hydroxylase (by graphene) 提交 2021-12-23	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–527（527 aa）链 E 1–527（527 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；30 mM HEPES, pH 7, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å

共 31 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MEMA_METCA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527 作者链 B； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527

Methane monooxygenase component A gamma chain

物种未注明

UniProt P11987

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 0–169 链 F； UniProt 0–169	未记录	Methane monooxygenase component A alpha chain × 2 （P22869） Methane monooxygenase component A beta chain × 2 FE FE (III) ION × 4 BHL 6-BROMOHEXAN-1-OL × 10 BBU 1-BROMOBUTANE × 1 BBX 1-BROMOETHANE × 1 CA CALCIUM ION × 1 3BR 1-BROMOPROPANE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.251

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1XVB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FYZ METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II REDUCED BY SOAKING 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 2.15 Å R-free 0.230
1FZ0 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II MIXED-VALENT GROWN ANAEROBICALLY 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.07 Å R-free 0.230
1FZ1 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III OXIDIZED 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.96 Å R-free 0.234
1FZ2 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II MIXED-VALENT GENERATED BY CRYSTAL SOAKING 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.15 Å R-free 0.229
1FZ3 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAK AT PH 6.2 (0.1 M PIPES) 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.03 Å R-free 0.228
1FZ4 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAKED AT PH 8.5 (0.1 M TRIS) 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 2.38 Å R-free 0.256
1FZ5 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II CRYSTALLIZED ANAEROBICALLY FROM REDUCED ENZYME 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE2 FE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 2.40 Å R-free 0.253
1FZ6 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II SOAKED IN 1 M METHANOL 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 MOH METHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.05 Å R-free 0.244
1FZ7 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAKED IN 0.9 M ETHANOL 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1 EOH ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K	分辨率 1.96 Å R-free 0.255
1FZ8 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II COCRYSTALLIZED WITH DIBROMOMETHANE 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 2BM DIBROMOMETHANE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, dibromomethane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
1FZ9 Methane monooxygenase hydroxylase, form II cocrystallized with iodoethane 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 ETI IODOETHANE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, iodoethane. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
1FZH METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II PRESSURIZED WITH XENON GAS 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 XE XENON × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
1FZI METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM I PRESSURIZED WITH XENON GAS 提交 2000-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–170（170 aa）链 F 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 XE XENON × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 4000, ammonium acetate, Li2SO4, MOPS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.253
1MMO CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL NON-HAEM IRON HYDROXYLASE THAT CATALYSES THE BIOLOGICAL OXIDATION OF METHANE 提交 1994-02-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 3–164（162 aa）链 H 3–164（162 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1MTY METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE FROM METHYLOCOCCUS CAPSULATUS (BATH) 提交 1996-07-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 3–164（162 aa）链 H 3–164（162 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；25 MM LI2SO4, 50 MM NH4OAC, 5% PEG 4000, IN 25 MM MOPS PH 7.0 WITH A RESERVOIR OF 20% PEG 4000	分辨率 1.70 Å
1XMF Structure of Mn(II)-Soaked Apo Methane Monooxygenase Hydroxylase Crystals from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–169（169 aa）片段：gamma subunit 链 F 1–169（169 aa）片段：gamma subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, CaCl2, PEG8000, glycerol, azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.32 Å R-free 0.263
1XMG Crystal structure of apo methane monooxygenase hydroxylase from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–169（169 aa）片段：gamma subunit 链 F 1–169（169 aa）片段：gamma subunit	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；MOPS, PEG 8000, calcium chloride, glycerol, azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.10 Å R-free 0.261
1XMH Structure of Co(II) reconstituted methane monooxygenase hydroxylase from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–169（169 aa）片段：gamma subunit 链 F 1–169（169 aa）片段：gamma subunit	未记录	CO COBALT (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；MOPS, PEG 8000, calcium chloride, sodium azide, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.32 Å R-free 0.225
1XU3 Soluble methane monooxygenase hydroxylase-soaked with bromophenol 提交 2004-10-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 BML 4-BROMOPHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, pH 7.00	分辨率 2.30 Å R-free 0.245
1XU5 Soluble methane monooxygenase hydroxylase-phenol soaked 提交 2004-10-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 OH HYDROXIDE ION × 2 IPH PHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.96 Å R-free 0.228
1XVC soluble methane monooxygenase hydroxylase: 8-bromooctanol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 BR BROMIDE ION × 2 5BR 1-BROMOPENTANE × 1 BMM BROMOMETHANE × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
1XVD Soluble methane monooxygenase hydroxylase: 4-fluorophenol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 FPN 4-FLUOROPHENOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, CaCl2, NaN3, glyerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 2.30 Å R-free 0.229
1XVE soluble methane monooxygenase hydroxylase: 3-bromo-3-butenol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 3BB 3-BROMOBUT-3-EN-1-OL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.260
1XVF soluble methane monooxygenase hydroxylase: chloropropanol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 3CL 3-CHLOROPROPANOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
1XVG soluble methane monooxygenase hydroxylase: bromoethanol soaked structure 提交 2004-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 0–169（170 aa）片段：gamma subunit 链 F 0–169（170 aa）片段：gamma subunit	未记录	FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 BRJ 2-BROMOETHANOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, CaCl2, NaN3, glyerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.96 Å R-free 0.230
4GAM Complex structure of Methane monooxygenase hydroxylase and regulatory subunit 提交 2012-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–170（170 aa）链 H 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES and 15% PEG 20,000 (w/v) ure 298K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.90 Å R-free 0.258
4GAM Complex structure of Methane monooxygenase hydroxylase and regulatory subunit 提交 2012-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 M 1–170（170 aa）链 R 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES and 15% PEG 20,000 (w/v) ure 298K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.90 Å R-free 0.258
7TC7 Cryo-EM structure of methane monooxygenase hydroxylase (by quantifoil) 提交 2021-12-23	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–170（170 aa）链 H 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；30 mM HEPES, pH 7, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7TC8 Cryo-EM structure of methane monooxygenase hydroxylase (by graphene) 提交 2021-12-23	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–170（170 aa）链 H 1–170（170 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；30 mM HEPES, pH 7, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å

共 28 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MEMG_METCA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–170； UniProt 0–169 作者链 F； PDB构建体 1–170； UniProt 0–169

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1xvb
沉积日期 deposition_date	2004-10-27
结构标题 title	soluble methane monooxygenase hydroxylase: 6-bromohexanol soaked structure
关键词 keywords	methane, diiron, cavities, products, four-helix bundle, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	40.90 Å
零角强度 I(0) i0	893621000.00
分子量 molecular_weight	246820.0 kDa
排除体积 excluded_volume	307590 Å³
包络体积 envelope_volume	357070 Å³
水化壳体积 shell_volume	69235 Å³
包络直径 envelope_diameter	134.4 Å
壳层 Rg shell_rg	48.87 Å
包络 Rg envelope_rg	40.87 Å
形状 Rg shape_rg	40.90 Å
总 Rg total_rg	41.22 Å
总原子数 total_atoms	17404
残基数 n_residues	2128
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	128.0 Å
Rg (实空间) rg_real	41.23 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.95 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.9360e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5970e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	893700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8704
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	43.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.275
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.588
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	439300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.953; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.454

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Methane monooxygenase component A alpha chain
分子量 formula_weight	60719.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.13.25
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	18520

MALSTATKAATDALAANRAPTSVNAQEVHRWLQSFNWDFKNNRTKYATKYKMANETKEQFKLIAKEYARMEAVKDERQFGSLQDALTRLNAGVRVHPKWNETMKVVSNFLEVGEYNAIAATGMLWDSAQAAEQKNGYLAQVLDEIRHTHQCAYVNYYFAKNGQDPAGHNDARRTRTIGPLWKGMKRVFSDGFISGDAVECSLNLQLVGEACFTNPLIVAVTEWAAANGDEITPTVFLSIETDELRHMANGYQTVVSIANDPASAKYLNTDLNNAFWTQQKYFTPVLGMLFEYGSKFKVEPWVKTWDRWVYEDWGGIWIGRLGKYGVESPRSLKDAKQDAYWAHHDLYLLAYALWPTGFFRLALPDQEEMEWFEANYPGWYDHYGKIYEEWRARGCEDPSSGFIPLMWFIENNHPIYIDRVSQVPFCPSLAKGASTLRVHEYNGEMHTFSDQWGERMWLAEPERYECQNIFEQYEGRELSEVIAELHGLRSDGKTLIAQPHVRGDKLWTLDDIKRLNCVFKNPVKAFN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Methane monooxygenase component A beta chain
分子量 formula_weight	45184.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.13.25
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MSMLGERRRGLTDPEMAAVILKALPEAPLDGNNKMGYFVTPRWKRLTEYEALTVYAQPNADWIAGGLDWGDWTQKFHGGRPSWGNETTELRTVDWFKHRDPLRRWHAPYVKDKAEEWRYTDRFLQGYSADGQIRAMNPTWRDEFINRYWGAFLFNEYGLFNAHSQGAREALSDVTRVSLAFWGFDKIDIAQMIQLERGFLAKIVPGFDESTAVPKAEWTNGEVYKSARLAVEGLWQEVFDWNESAFSVHAVYDALFGQFVRREFFQRLAPRFGDNLTPFFINQAQTYFQIAKQGVQDLYYNCLGDDPEFSDYNRTVMRNWTGKWLEPTIAALRDFMGLFAKLPAGTTDKEEITASLYRVVDDWIEDYASRIDFKADRDQIVKAVLAGLK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Methane monooxygenase component A gamma chain
分子量 formula_weight	19879.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.13.25
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MAKLGIHSNDTRDAWVNKIAQLNTLEKAAEMLKQFRMDHTTPFRNSYELDNDYLWIEAKLEEKVAVLKARAFNEVDFRHKTAFGEDAKSVLDGTVAKMNAAKDKWEAEKIHIGFRQAYKPPIMPVNYFLDGERQLGTRLMELRNLNYYDTPLEELRKQRGVRVVHLQSPH

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	6-BROMOHEXAN-1-OL
分子量 formula_weight	181.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1-BROMOBUTANE
分子量 formula_weight	137.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	1-BROMOETHANE
分子量 formula_weight	109.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	1-BROMOPROPANE
分子量 formula_weight	123.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 10 Entity 10 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1116

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1xvba_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d1xvbb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d1xvbc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d1xvbd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d1xvbe_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.23 — Open three-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.23.3 — Methane monooxygenase hydrolase, gamma subunit
家族 Family family	a.23.3.1 — Methane monooxygenase hydrolase, gamma subunit

结构域编号 domain_id	d1xvbf_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.23 — Open three-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.23.3 — Methane monooxygenase hydrolase, gamma subunit
家族 Family family	a.23.3.1 — Methane monooxygenase hydrolase, gamma subunit

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1xvbA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	1xvbB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	1xvbC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	1xvbD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A

结构域编号 domain_id	1xvbE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methane monooxygenase, gamma chain, domain 1

结构域编号 domain_id	1xvbE02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Methane monooxygenase, gamma chain, domain 2

结构域编号 domain_id	1xvbF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methane monooxygenase, gamma chain, domain 1

结构域编号 domain_id	1xvbF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Methane monooxygenase, gamma chain, domain 2

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	70.632 Å
晶胞边长 b length_b	171.867 Å
晶胞边长 c length_c	220.622 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.800 Å
最低分辨率 resolution_low	29.850 Å
R 因子 r_factor	0.2190
R_work r_work	0.2190
R_free r_free	0.2510

fit	/app/data/saxs_computation/xv/1xvb/1xvb.fit
pddf	/app/data/pr_computation/xv/1xvb/1xvb.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/xv/1xvb/1xvb.dat

soluble methane monooxygenase hydroxylase: 6-bromohexanol soaked structure

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methane monooxygenase component A alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Methane monooxygenase component A gamma chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)