← 返回搜索
1y0g

CRYSTAL STRUCTURE OF THE ESCHERICHIA COLI YCEI PROTEIN, STRUCTURAL GENOMICS

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein yceI

Escherichia coli

UniProt P0A8X2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 2-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E,26E)-3,7,11,15,19,23,27,31-OCTAMETHYLDOTRIACONTA-2,6,10,14,18,22,26,30-OCTAENYL]PHENOL × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 2-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E,26E)-3,7,11,15,19,23,27,31-OCTAMETHYLDOTRIACONTA-2,6,10,14,18,22,26,30-OCTAENYL]PHENOL × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
1y0g 1y0g

共 2 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 YCEI_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–191； UniProt 1–191 作者链 B； PDB构建体 1–191； UniProt 1–191 作者链 C； PDB构建体 1–191； UniProt 1–191 作者链 D； PDB构建体 1–191； UniProt 1–191

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1y0g
沉积日期 deposition_date2004-11-15
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF THE ESCHERICHIA COLI YCEI PROTEIN, STRUCTURAL GENOMICS
关键词 keywords;Lipid Binding Protein, lipocalin, cofactor, coenzyme, dehydrogenase, hydrolase, predicted, Structural Genomics, Protein Structure Initiative, PSI, NYSGXRC, New York SGX Research Center for Structural Genomics ;; LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1y0g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1y0g__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1y0g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）21.88 Å
Rg（电子密度）20.59 Å
总 Rg21.62 Å
原子数2740
残基数338
排除体积48932 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1y0g__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1y0g__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1y0ga_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.61 — Streptavidin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.61.6 — YceI-like
家族 Family familyb.61.6.1 — YceI-like
结构域编号 domain_idd1y0gb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.61 — Streptavidin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.61.6 — YceI-like
家族 Family familyb.61.6.1 — YceI-like
结构域编号 domain_idd1y0gc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.61 — Streptavidin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.61.6 — YceI-like
家族 Family familyb.61.6.1 — YceI-like
结构域编号 domain_idd1y0gd_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.61 — Streptavidin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.61.6 — YceI-like
家族 Family familyb.61.6.1 — YceI-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1y0gA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Lipid/polyisoprenoid-binding, YceI-like
结构域编号 domain_id1y0gB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Lipid/polyisoprenoid-binding, YceI-like
结构域编号 domain_id1y0gC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Lipid/polyisoprenoid-binding, YceI-like
结构域编号 domain_id1y0gD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Lipid/polyisoprenoid-binding, YceI-like
▶

7. 引用文献 (1)