1ybx
Conserved hypothetical protein Cth-383 from Clostridium thermocellum
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1ybx |
| 沉积日期 deposition_date | 2004-12-21 |
| 结构标题 title | Conserved hypothetical protein Cth-383 from Clostridium thermocellum |
| 关键词 keywords | ;conserved hypothetical protein, Clostridium thermocellum, Structural Genomics, PSI, Protein Structure Initiative, Southeast Collaboratory for Structural Genomics, SECSG, unknown function ;; structural genomics, unknown function |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1ybx__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。 | ||||||
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1ybxa_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.222 — YbaB-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.222.1 — YbaB-like |
| 家族 Family family | d.222.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d1ybxb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.222 — YbaB-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.222.1 — YbaB-like |
| 家族 Family family | d.222.1.0 — automated matches |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1ybxA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1310 — Ybab; Chain: A; |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nucleoid-associated protein YbaB-like domain |
| 结构域编号 domain_id | 1ybxB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 1310 — Ybab; Chain: A; |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nucleoid-associated protein YbaB-like domain |