1yiq

Molecular cloning and structural analysis of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADHIIG from Pseudomonas putida HK5. Compariison to the other quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADHIIB found in the same microorganism.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase

物种未注明

UniProt Q4W6G0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 CALCIUM ION × 1 PYRROLOQUINOLINE QUINONE × 1 HEME C × 1 R-1,2-PROPANEDIOL × 3 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q4W6G0_PSEPU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–689; UniProt 30–718

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1yiq
沉积日期 deposition_date2005-01-12
结构标题 titleMolecular cloning and structural analysis of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADHIIG from Pseudomonas putida HK5. Compariison to the other quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADHIIB found in the same microorganism.
关键词 keywordsQUINOHEMOPROTEIN ALCOHOL DEHYDROGENASE, ELECTRON TRANSFER, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1yiq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1yiq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1yiq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.89 Å
Rg(电子密度)23.87 Å
总 Rg24.83 Å
原子数5365
残基数684
排除体积94932 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1yiq__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1yiqA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture140 — 8 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methanol Dehydrogenase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like superfamily
结构域编号 domain_id1yiqA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome c-like domain
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7. 引用文献 (2)