Oryza sativa
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q6VAK4_ORYSA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 B； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 |
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| 条目编号 entry_id | 1yvi |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-02-15 |
| 结构标题 title | X-RAY STRUCTURE OF PUTATIVE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN FROM RICE, AK104879 |
| 关键词 keywords | ;STRUCTURAL GENOMICS, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, PSI, CESG, AK104879, PHOSPHORELAY MEDIATOR, HP1, Center for Eukaryotic Structural Genomics, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.36 Å |
| Rg（电子密度） | 16.55 Å |
| 总 Rg | 17.46 Å |
| 原子数 | 1079 |
| 残基数 | 136 |
| 排除体积 | 19218 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1yvia1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.10 — Histidine-containing phosphotransfer domain, HPT domain |
| 家族 Family family | a.24.10.2 — Phosphorelay protein-like |
| 结构域编号 domain_id | d1yvia2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d1yvib_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.10 — Histidine-containing phosphotransfer domain, HPT domain |
| 家族 Family family | a.24.10.2 — Phosphorelay protein-like |
| 结构域编号 domain_id | 1yviA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 160 — HPT domain |
| 结构域编号 domain_id | 1yviB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 160 — HPT domain |