SAXSdb — 1z63

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Helicase of the snf2/rad54 family

Sulfolobus solfataricus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	单体	蛋白 1 DNA 2	5'-D(APAPAPAPAPAAPTPTPGPCPCPGPAPAPGPAPCPGPAPAPAPAPAPA)-3' × 1 5'-D(TPTPTPTPTPTPTPCPGPTPCPTPTPCPGPGPCPAPAPTPTPTPTPTPT)-3' × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	单体	蛋白 1 DNA 2	5'-D(APAPAPAPAPAAPTPTPGPCPCPGPAPAPGPAPCPGPAPAPAPAPAPA)-3' × 1 5'-D(TPTPTPTPTPTPTPCPGPTPCPTPTPCPGPGPCPAPAPTPTPTPTPTPT)-3' × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q97XQ5_SULSO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 24–383； UniProt 430–789 作者链 A； PDB构建体 384–496； UniProt 8–120 作者链 B； PDB构建体 24–383； UniProt 430–789 作者链 B； PDB构建体 384–496； UniProt 8–120

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1z63
沉积日期 deposition_date	2005-03-21
结构标题 title	Sulfolobus solfataricus SWI2/SNF2 ATPase core in complex with dsDNA
关键词 keywords	protein-DNA complex, HYDROLASE-DNA complex COMPLEX; HYDROLASE/DNA complex
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1z63__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1z63__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1z63__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.60 Å
Rg（电子密度）	25.38 Å
总 Rg	26.24 Å
原子数	4577
残基数	497
排除体积	80302 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1z63__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1z63__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	5'-D(APAPAPAPAPAAPTPTPGPCPCPGPAPAPGPAPCPGPAPAPAPAPAP*A)-3'
分子量 formula_weight	7759.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C,E
原子数 atom_count	9154

AAAAAAATTGCCGAAGACGAAAAAA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	5'-D(TPTPTPTPTPTPTPCPGPTPCPTPTPCPGPGPCPAPAPTPTPTPTPTP*T)-3'
分子量 formula_weight	7592.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D,F

TTTTTTTCGTCTTCGGCAATTTTTT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Helicase of the snf2/rad54 family
分子量 formula_weight	57609.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASKSFQLLEPYNIKANLRPYQIKGFSWMRFMNKLGFGICLADDMGLGKTLQTIAVFSDAKKENELTPSLVICPLSVLKNWEEELSKFAPHLRFAVFHEDRSKIKLEDYDIILTTYAVLLRDTRLKEVEWKYIVIDEAQNIKNPQTKIFKAVKELKSKYRIALTGTPIENKVDDLWSIMTFLNPGLLGSYSEFKSKFATPIKKGDNMAKEELKAIISPFILRRTKYDKAIINDLPDKIETNVYCNLTPEQAAMYKAEVENLFNNIDSVTGIKRKGMILSTLLKLKQIVDHPALLKGGEQSVRRSGKMIRTMEIIEEALDEGDKIAIFTQFVDMGKIIRNIIEKELNTEVPFLYGELSKKERDDIISKFQNNPSVKFIVLSVKAGGFGINLTSANRVIHFDRWWNPAVEDQATDRVYRIGQTRNVIVHKLISVGTLEEKIDQLLAFKRSLFKDIISSGDSWITELSTEELRKVIELSVGGY

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus solfataricus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1z63a1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.19 — Tandem AAA-ATPase domain

结构域编号 domain_id	d1z63a2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.19 — Tandem AAA-ATPase domain

结构域编号 domain_id	d1z63b1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.19 — Tandem AAA-ATPase domain

结构域编号 domain_id	d1z63b2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.19 — Tandem AAA-ATPase domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1z63A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10810 — Tandem AAA-ATPase domain

结构域编号 domain_id	1z63A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1z63A03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	850 — SWI2/SNF2 ATPases, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1z63B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10810 — Tandem AAA-ATPase domain

结构域编号 domain_id	1z63B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1z63B03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	850 — SWI2/SNF2 ATPases, N-terminal domain

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晶胞边长 a length_a	86.931 Å
晶胞边长 b length_b	83.737 Å
晶胞边长 c length_c	106.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	109.78 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2330
R_work r_work	0.2330
R_free r_free	0.2810

Sulfolobus solfataricus SWI2/SNF2 ATPase core in complex with dsDNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Helicase of the snf2/rad54 family

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1z63__assembly_1__model_1

1z63__assembly_1__model_1 | I(q)

1z63__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Sulfolobus solfataricus SWI2/SNF2 ATPase core in complex with dsDNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Helicase of the snf2/rad54 family

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1z63__assembly_1__model_1

1z63__assembly_1__model_1 | I(q)

1z63__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)