1z7e

Crystal structure of full length ArnA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

protein ArnA

Escherichia coli

UniProt P77398

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ;URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCURONIC ACID ; × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARNA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 B; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 C; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 D; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 E; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660 作者链 F; PDB构建体 1–660; UniProt 1–660

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1z7e
沉积日期 deposition_date2005-03-24
结构标题 titleCrystal structure of full length ArnA
关键词 keywordsRossmann fold; OB-like fold, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1z7e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1z7e__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1z7e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)53.07 Å
Rg(电子密度)52.81 Å
总 Rg53.07 Å
原子数30556
残基数3839
排除体积541530 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1z7e__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

结构域编号 domain_idd1z7ea1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.46 — FMT C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.46.1 — FMT C-terminal domain-like
家族 Family familyb.46.1.1 — Post formyltransferase domain
结构域编号 domain_idd1z7ea2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1z7ea3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.65 — Formyltransferase
超家族 Superfamily superfamilyc.65.1 — Formyltransferase
家族 Family familyc.65.1.1 — Formyltransferase
结构域编号 domain_idd1z7eb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.46 — FMT C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.46.1 — FMT C-terminal domain-like
家族 Family familyb.46.1.1 — Post formyltransferase domain
结构域编号 domain_idd1z7eb2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1z7eb3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.65 — Formyltransferase
超家族 Superfamily superfamilyc.65.1 — Formyltransferase
家族 Family familyc.65.1.1 — Formyltransferase
结构域编号 domain_idd1z7ec1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.46 — FMT C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.46.1 — FMT C-terminal domain-like
家族 Family familyb.46.1.1 — Post formyltransferase domain
结构域编号 domain_idd1z7ec2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1z7ec3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.65 — Formyltransferase
超家族 Superfamily superfamilyc.65.1 — Formyltransferase
家族 Family familyc.65.1.1 — Formyltransferase
结构域编号 domain_idd1z7ed1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.46 — FMT C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.46.1 — FMT C-terminal domain-like
家族 Family familyb.46.1.1 — Post formyltransferase domain
结构域编号 domain_idd1z7ed2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1z7ed3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.65 — Formyltransferase
超家族 Superfamily superfamilyc.65.1 — Formyltransferase
家族 Family familyc.65.1.1 — Formyltransferase
结构域编号 domain_idd1z7ee1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.46 — FMT C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.46.1 — FMT C-terminal domain-like
家族 Family familyb.46.1.1 — Post formyltransferase domain
结构域编号 domain_idd1z7ee2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1z7ee3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.65 — Formyltransferase
超家族 Superfamily superfamilyc.65.1 — Formyltransferase
家族 Family familyc.65.1.1 — Formyltransferase
结构域编号 domain_idd1z7ef1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.46 — FMT C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.46.1 — FMT C-terminal domain-like
家族 Family familyb.46.1.1 — Post formyltransferase domain
结构域编号 domain_idd1z7ef2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases
结构域编号 domain_idd1z7ef3
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.65 — Formyltransferase
超家族 Superfamily superfamilyc.65.1 — Formyltransferase
家族 Family familyc.65.1.1 — Formyltransferase

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id1z7eA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12230 —
结构域编号 domain_id1z7eA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1z7eB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12230 —
结构域编号 domain_id1z7eB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1z7eC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12230 —
结构域编号 domain_id1z7eC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1z7eD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12230 —
结构域编号 domain_id1z7eD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1z7eE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12230 —
结构域编号 domain_id1z7eE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id1z7eF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12230 —
结构域编号 domain_id1z7eF02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
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7. 引用文献 (1)