1z9o

1.9 Angstrom Crystal Structure of the Rat VAP-A MSP Homology Domain in Complex with the Rat ORP1 FFAT Motif

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Oxysterol binding protein

物种未注明

UniProt Q8K4M9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 Vesicle-associated membrane protein-associated protein A × 6 water × 12 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8K4M9_RAT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–10; UniProt 472–481 作者链 H; PDB构建体 1–10; UniProt 472–481 作者链 I; PDB构建体 1–10; UniProt 472–481 作者链 J; PDB构建体 1–10; UniProt 472–481 作者链 K; PDB构建体 1–10; UniProt 472–481 作者链 L; PDB构建体 1–10; UniProt 472–481

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1z9o
沉积日期 deposition_date2005-04-03
结构标题 title1.9 Angstrom Crystal Structure of the Rat VAP-A MSP Homology Domain in Complex with the Rat ORP1 FFAT Motif
关键词 keywords;VAP-33, VAP-A, VAP-B, VAP-C, VAPA, VAPB, VAPC, VAP-33a, Scs2, ERG30, FFAT motif, ER, endoplasmic reticulum, targeting, immunoglobulin-like beta sheet, MSP homology domain, OSBP, ORP, oxysterol binding protein, PROTEIN BINDING-LIPID BINDING PROTEIN COMPLEX ;; PROTEIN BINDING/LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1z9o__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1z9o__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1z9o__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)32.43 Å
Rg(电子密度)32.03 Å
总 Rg32.49 Å
原子数6144
残基数768
排除体积110380 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1z9o__assembly_1__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1z9oA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1z9oB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1z9oC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1z9oD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1z9oE00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1z9oF00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
▶

7. 引用文献 (1)