Synechocystis sp. PCC 6803
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ZINC ION × 1 CALCIUM ION × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DP3A_SYNY3 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–172； UniProt 770–936 |
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| 条目编号 entry_id | 1zde |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-04-14 |
| 结构标题 title | 1.95 Angstrom Crystal Structure of a dnaE Intein Precursor from Synechocystis Sp. Pcc 6803 |
| 关键词 keywords | DnaE, Intein, Splicing, Precursor, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.45 Å |
| Rg（电子密度） | 14.98 Å |
| 总 Rg | 16.17 Å |
| 原子数 | 1270 |
| 残基数 | 160 |
| 排除体积 | 22733 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1zdea1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.86 — Hedgehog/intein (Hint) domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.86.1 — Hedgehog/intein (Hint) domain |
| 家族 Family family | b.86.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d1zdea2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 1zdeA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 170 — Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 16 — Endonuclease - Pi-scei; Chain A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hedgehog/Intein (Hint) domain |