1zgh
Methionyl-tRNA formyltransferase from Clostridium thermocellum
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 1 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1zgh |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-04-21 |
| 结构标题 title | Methionyl-tRNA formyltransferase from Clostridium thermocellum |
| 关键词 keywords | ;Methionyl-tRNA formyltransferase, Southeast Collaboratory for Structural Genomics, Clostridium thermocellum, PSI, Protein Structure Initiative, SECSG, Transferase ;; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 1zgh__assembly_1__model_1 |
monomeric (1) | 排除 | — | — |
| 排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。 | ||||||
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains
SCOP 2.08 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1zgha1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.46 — FMT C-terminal domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.46.1 — FMT C-terminal domain-like |
| 家族 Family family | b.46.1.1 — Post formyltransferase domain |
| 结构域编号 domain_id | d1zgha2 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.65 — Formyltransferase |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.65.1 — Formyltransferase |
| 家族 Family family | c.65.1.1 — Formyltransferase |
| 结构域编号 domain_id | d1zgha3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1zghA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 170 — Formyl transferase, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 1zghA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 25 — Methionyl-tRNA Fmet Formyltransferase; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — |