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1F3M
CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN SERINE/THREONINE KINASE PAK1
提交 2000-06-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
70–149(80 aa)
片段:PAK1 AUTOREGULATORY DOMAIN (70-149)
链 B
70–149(80 aa)
片段:PAK1 AUTOREGULATORY DOMAIN (70-149)
链 C
249–545(297 aa)
片段:KINASE DOMAIN (249-545)
链 D
249–545(297 aa)
片段:KINASE DOMAIN (249-545)
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突变:K299R
突变:K299R
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IOD IODIDE ION × 28
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;285 K;Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.258
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1YHV
Crystal Structure of PAK1 kinase domain with two point mutations (K299R, T423E)
提交 2005-01-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
249–545(297 aa)
片段:kinase domain
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突变:K299R, T423E
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 4000, NaCl, PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.240
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1YHW
Crystal Structure of PAK1 kinase domain with one point mutations (K299R)
提交 2005-01-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
249–545(297 aa)
片段:kinase domain
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突变:K299R
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 4000, NaCl, PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.243
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28OQ
Protein Kinaze domain PAK1 complexed with NVS inhibitor
提交 2026-02-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
249–545(297 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulfate , 24 % (w/v) PEG 1357 3350
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分辨率 2.28 Å
R-free 0.266
|
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28OQ
Protein Kinaze domain PAK1 complexed with NVS inhibitor
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
249–545(297 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CL CHLORIDE ION × 1
A1JZR (3~{S})-3-[(~{Z})-[11-[2,2-bis(fluoranyl)ethyl]-8-chloranyl-3-fluoranyl-5~{H}-benzo[b][1,4]benzodiazepin-6-ylidene]amino]-~{N}-propan-2-yl-pyrrolidine-1-carboxamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulfate , 24 % (w/v) PEG 1357 3350
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.266
|
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2HY8
PAK1 complex with ST2001
提交 2006-08-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 1
249–545(297 aa)
片段:kinase domain (residues 249-545)
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突变:K299R, T423E
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1ST (5S,6R,7R,9R)-12-HYDROXY-6-METHOXY-5-METHYL-7-(METHYLAMINO)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-5H,14H-5,9-EPOXY-4B,9A,15-TRIAZADIBENZO[ B,H]CYCLONONA[1,2,3,4-JKL]CYCLOPENTA[E]-AS-INDACEN-14-ONE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;1:1 ration of protein and precipitant. Precipitant: 0.13 M PIPES pH 6.5, 1.5 M NaCl, 23% PEG 4000, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.234
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2QME
Crystal structure of human RAC3 in complex with CRIB domain of human p21-activated kinase 1 (PAK1)
提交 2007-07-16
|
构建体不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 I
74–109(36 aa)
片段:CRIB domain
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
GOL GLYCEROL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 2 M (NH4)2S04, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.192
|
|
2QME
Crystal structure of human RAC3 in complex with CRIB domain of human p21-activated kinase 1 (PAK1)
提交 2007-07-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 I
74–109(36 aa)
片段:CRIB domain
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 2
GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
GOL GLYCEROL × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 2 M (NH4)2S04, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.192
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3DVP
Pak1 peptide bound LC8
提交 2008-07-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 C
212–221(10 aa)
链 D
212–221(10 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES, 200 mM NaCl, 27% (w/v) PEG 4000, and 10% 0.1 M (NH4)6CoCl3, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.263
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3FXZ
Crystal structure of PAK1 kinase domain with ruthenium complex lambda-FL172
提交 2009-01-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:UNP residues 249-545
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突变:K299R
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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FLL OCTAHEDRAL RU-PYRIDOCARBAZOLE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;0.1M Tris pH 8.0, 1M NaCl, 25% PEG 4000, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.218
|
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3FY0
Crystal structure of PAK1 kinase domain with ruthenium complex DW1
提交 2009-01-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:UNP residues 249-545
|
突变:K299R
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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DW1 Ruthenium pyridocarbazole × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M HEPES pH 7.5, 1M NaCl, 25% PEG 10000, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.260
|
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3Q4Z
Structure of unphosphorylated PAK1 kinase domain
提交 2010-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
248–545(298 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 248-545
链 B
248–545(298 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 248-545
|
突变:S259I, K299R, D389N, L516I
突变:S259I, K299R, D389N, L516I
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M Hepes pH 7.5, 25% PEG 3350, 0.2M Ammonium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.231
|
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3Q52
Structure of phosphorylated PAK1 kinase domain
提交 2010-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
248–545(298 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 248-545
|
突变:K299R, L516I
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;294 K;25% PEG 3350, 0.2M Na/K Tartrate, 0.1M NDSB256, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.214
|
|
3Q53
Structure of phosphorylated PAK1 kinase domain in complex with ATP
提交 2010-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
248–545(298 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 248-545
|
突变:K299R, L516I
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;294 K;25% PEG 3350, 0.2M Na/K Tartrate, 0.1M NDSB256, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.223
|
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4DAW
Crystal structure of PAK1 kinase domain with the ruthenium phthalimide complex
提交 2012-01-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
突变:K299R
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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0H2 [1,3-dioxo-6-(pyridin-2-yl-kappaN)-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-yl-kappaC~5~][(thioxomethylidene)azanido-kappaN](1,4,7-trithionane-kappa~3~S~1~,S~4~,S~7~)ruthenium × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;25 PEG 4000, 1 M NaCl, 10 mM DTT, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.238
|
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4EQC
Crystal structure of PAK1 kinase domain in complex with FRAX597 inhibitor
提交 2012-04-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
突变:K299R
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
XR1 6-[2-chloro-4-(1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-8-ethyl-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;0.1 M HEPES, 1 M NaCl, 25% PEG 3350, 10 mM DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.253
|
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4O0R
Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors
提交 2013-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
未记录
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7KC PF-3758309 × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.242
|
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4O0R
Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors
提交 2013-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.242
|
|
4O0R
Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors
提交 2013-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
链 B
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
未记录
|
7KC PF-3758309 × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.242
|
|
4O0T
Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors
提交 2013-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
未记录
|
2OL 1-({1-(2-aminopyrimidin-4-yl)-2-[(2-methoxyethyl)amino]-1H-benzimidazol-6-yl}ethynyl)cyclohexanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.265
|
|
4O0T
Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors
提交 2013-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.265
|
|
4O0T
Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors
提交 2013-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
链 B
249–545(297 aa)
片段:unp residues 249-545
|
未记录
|
2OL 1-({1-(2-aminopyrimidin-4-yl)-2-[(2-methoxyethyl)amino]-1H-benzimidazol-6-yl}ethynyl)cyclohexanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.265
|
|
4P90
Crystal structure of the kinase domain of human PAK1 in complex with compound 15
提交 2014-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
突变:D389N, T423E, E503D
|
2K0 [2-chloro-5-(hydroxymethyl)phenyl]{5-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl}methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M ammonium sulphate, 16% PEG 3350, 0.1M Hepes (pH 7.6)
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.225
|
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4P90
Crystal structure of the kinase domain of human PAK1 in complex with compound 15
提交 2014-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
|
突变:D389N, T423E, E503D
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2K0 [2-chloro-5-(hydroxymethyl)phenyl]{5-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl}methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M ammonium sulphate, 16% PEG 3350, 0.1M Hepes (pH 7.6)
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.225
|
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4ZJI
PAK1 in complex with 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
未记录
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4OQ 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (1.0 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 17.2% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.220
|
|
4ZJI
PAK1 in complex with 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
|
未记录
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4OQ 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (1.0 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 17.2% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.220
|
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4ZJI
PAK1 in complex with 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
249–545(297 aa)
|
未记录
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4OQ 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (1.0 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 17.2% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.220
|
|
4ZJI
PAK1 in complex with 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
249–545(297 aa)
|
未记录
|
4OQ 2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-dibenzodiazepine × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (1.0 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 17.2% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.220
|
|
4ZJJ
PAK1 in complex with (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
未记录
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4OR (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (0.8 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 16.8% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
4ZJJ
PAK1 in complex with (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
|
未记录
|
4OR (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (0.8 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 16.8% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
4ZJJ
PAK1 in complex with (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
249–545(297 aa)
|
未记录
|
4OR (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (0.8 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 16.8% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
4ZJJ
PAK1 in complex with (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide
提交 2015-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
249–545(297 aa)
|
未记录
|
4OR (S)-N-(tert-butyl)-3-((2-chloro-5-ethyl-8-fluoro-dibenzodiazepin-11-yl)amino)pyrrolidine-1-carboxamide × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Equal volumes (0.8 uL) of reservoir solution and protein solution were mixed. Reservoir solution: 16.8% (w/v) PEG3350, 0.2 M magnesium formate (dihydrate)
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
4ZLO
Serine/threonine-protein kinase PAK1 complexed with a dibenzodiazepine: identification of an allosteric site on PAK1
提交 2015-05-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
链 B
249–545(297 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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4PV 2,8-difluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-5H-dibenzo[b,e][1,4]diazepine × 1
GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;22-27% PEG3350, 500-700MM NACL, 100MM BIS-TRIS, PH 6.5
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.222
|
|
4ZLO
Serine/threonine-protein kinase PAK1 complexed with a dibenzodiazepine: identification of an allosteric site on PAK1
提交 2015-05-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
链 B
249–545(297 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
4PV 2,8-difluoro-11-(4-methylpiperazin-1-yl)-5H-dibenzo[b,e][1,4]diazepine × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;22-27% PEG3350, 500-700MM NACL, 100MM BIS-TRIS, PH 6.5
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.222
|
|
4ZY4
Crystal structure of P21 activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 4
提交 2015-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N
|
4T3 2-(4-aminopiperidin-1-yl)-N-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.248
|
|
4ZY4
Crystal structure of P21 activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 4
提交 2015-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N
|
4T3 2-(4-aminopiperidin-1-yl)-N-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.248
|
|
4ZY5
Crystal Structure of p21-activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 17
提交 2015-05-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
未记录
|
4T5 N~2~-[(trans-4-aminocyclohexyl)methyl]-N~4~-(3-cyclopropyl-1H-pyrazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.230
|
|
4ZY5
Crystal Structure of p21-activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 17
提交 2015-05-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
未记录
|
4T5 N~2~-[(trans-4-aminocyclohexyl)methyl]-N~4~-(3-cyclopropyl-1H-pyrazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.230
|
|
4ZY6
Crystal structure of P21-activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 29
提交 2015-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N
|
4T6 N~2~-[(7-chloro-1H-benzimidazol-6-yl)methyl]-N~4~-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.239
|
|
4ZY6
Crystal structure of P21-activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 29
提交 2015-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N
|
4T6 N~2~-[(7-chloro-1H-benzimidazol-6-yl)methyl]-N~4~-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.239
|
|
5DEW
Crystal structure of PAK1 in complex with an inhibitor compound 5
提交 2015-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N, T423E
|
59N 8-[(trans-4-aminocyclohexyl)methyl]-6-[2-chloro-4-(6-methylpyrazin-2-yl)phenyl]-2-(ethylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.215
|
|
5DEW
Crystal structure of PAK1 in complex with an inhibitor compound 5
提交 2015-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N, T423E
|
59N 8-[(trans-4-aminocyclohexyl)methyl]-6-[2-chloro-4-(6-methylpyrazin-2-yl)phenyl]-2-(ethylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.215
|
|
5DEY
Crystal structure of PAK1 in complex with an inhibitor compound G-5555
提交 2015-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N, T423E
|
59T 8-[(trans-5-amino-1,3-dioxan-2-yl)methyl]-6-[2-chloro-4-(6-methylpyridin-2-yl)phenyl]-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.228
|
|
5DEY
Crystal structure of PAK1 in complex with an inhibitor compound G-5555
提交 2015-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:D389N, T423E
|
59T 8-[(trans-5-amino-1,3-dioxan-2-yl)methyl]-6-[2-chloro-4-(6-methylpyridin-2-yl)phenyl]-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.228
|
|
5DFP
Crystal structure of PAK1 in complex with an inhibitor compound FRAX1036
提交 2015-08-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:Protein kinase domain residue 249-545
|
突变:K299R
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
59U 6-[2-chloro-4-(6-methylpyrazin-2-yl)phenyl]-8-ethyl-2-{[2-(1-methylpiperidin-4-yl)ethyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;1 uL of PAK1 (9 mg/ml) with 1 uL of crystallization solution (0.1 M HEPES pH 7.0, 1 M NaCl, 25% PEG 3350, 10 mM DTT) at 4C
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.246
|
|
5IME
Crystal structure of P21-activated kinase 1 (PAK1) in complex with compound 9
提交 2016-03-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:residues 249-545
|
未记录
|
6BZ 8-(3-aminopropyl)-6-[2-chloro-4-(3-methyl-2-oxopyrazin-1(2H)-yl)phenyl]-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.263
|
|
5IME
Crystal structure of P21-activated kinase 1 (PAK1) in complex with compound 9
提交 2016-03-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:residues 249-545
|
未记录
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6BZ 8-(3-aminopropyl)-6-[2-chloro-4-(3-methyl-2-oxopyrazin-1(2H)-yl)phenyl]-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;crystals were grown at 19 C from 1.0 uL + 1.0 uL vapor diffusion drops containing 10 mg/mL protein, 1 mM ligand, 0.15 M DL-Malic Acid, 20% - 30% PEG 3350, 4% 1,3-Propanediol and 0.1 M Sodium Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.263
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|
5KBQ
Pak1 in complex with bis-anilino pyrimidine inhibitor
提交 2016-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
254–542(289 aa)
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突变:D389N, T423E, E503D
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IPV [4-methyl-3-[methyl-[2-[(3-methylsulfonyl-5-morpholin-4-yl-phenyl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]methanol × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M ammonium sulphate, 16% PEG 3350, 0.1M Hepes (pH 7.6)
|
分辨率 2.58 Å
R-free 0.230
|
|
5KBQ
Pak1 in complex with bis-anilino pyrimidine inhibitor
提交 2016-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
254–542(289 aa)
|
突变:D389N, T423E, E503D
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M ammonium sulphate, 16% PEG 3350, 0.1M Hepes (pH 7.6)
|
分辨率 2.58 Å
R-free 0.230
|
|
5KBR
Pak1 in complex with 7-azaindole inhibitor
提交 2016-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
254–542(289 aa)
|
突变:D389N, T423E, E503D
|
IPW (4-chlorophenyl)-[5-(1-piperidin-4-ylpyrazol-4-yl)-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M ammonium sulphate, 16% PEG 3350, 0.1M Hepes (pH 7.6)
|
分辨率 2.36 Å
R-free 0.255
|
|
5KBR
Pak1 in complex with 7-azaindole inhibitor
提交 2016-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
254–542(289 aa)
|
突变:D389N, T423E, E503D
|
IPW (4-chlorophenyl)-[5-(1-piperidin-4-ylpyrazol-4-yl)-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M ammonium sulphate, 16% PEG 3350, 0.1M Hepes (pH 7.6)
|
分辨率 2.36 Å
R-free 0.255
|
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6B16
P21-activated kinase 1 in complex with a 4-azaindole inhibitor
提交 2017-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
片段:UNP residues 249-545
|
未记录
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C7Y N~4~-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)-N~2~-[(1S)-1-(1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-5-yl)ethyl]pyrimidine-2,4-diamine × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.250
|
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6B16
P21-activated kinase 1 in complex with a 4-azaindole inhibitor
提交 2017-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
片段:UNP residues 249-545
|
未记录
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C7Y N~4~-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)-N~2~-[(1S)-1-(1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-5-yl)ethyl]pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;25% PEG 3500, 0.2M Ammonium Sulfate and 0.1M Tris pH 8
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.250
|
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7VTO
The crystal structure of PAK1 with the inhibitor GW8510
提交 2021-10-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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107 4-[(7-OXO-7H-THIAZOLO[5,4-E]INDOL-8-YLMETHYL)-AMINO]-N-PYRIDIN-2-YL-BENZENESULFONAMIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 MgCl2, 24% PEG 3350, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.252
|
|
7VTO
The crystal structure of PAK1 with the inhibitor GW8510
提交 2021-10-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
107 4-[(7-OXO-7H-THIAZOLO[5,4-E]INDOL-8-YLMETHYL)-AMINO]-N-PYRIDIN-2-YL-BENZENESULFONAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 MgCl2, 24% PEG 3350, 5 mM TCEP
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.252
|
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8X5Z
The Crystal Structure of PAK1 kinase domain from Biortus.
提交 2023-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
突变:K299R,E503D
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M SPG pH6.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.216
|
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9D4V
Structure of PAK1 in complex with compound 7
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–476(228 aa)
链 A
477–545(69 aa)
|
突变:D389N,T423E
突变:D389N,T423E
|
A1A2P N~2~-{[(1s,4s)-4-aminocyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2 M Na-malonate, pH 7.0, 0.15 M DL-malic acid, 4% propane-diol, and 16% PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.269
|
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9D4V
Structure of PAK1 in complex with compound 7
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–476(228 aa)
链 B
477–545(69 aa)
|
突变:D389N,T423E
突变:D389N,T423E
|
A1A2P N~2~-{[(1s,4s)-4-aminocyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2 M Na-malonate, pH 7.0, 0.15 M DL-malic acid, 4% propane-diol, and 16% PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.269
|
|
9D4W
Structure of PAK1 in complex with compound 12
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2Q N~2~-{[(1s,4s)-4-aminocyclohexyl]methyl}-N~4~-[5-(trifluoromethyl)-1,3-thiazol-2-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;0.1 M Na-malonate buffer, pH 6.6 , 0.15 M DL-malic acid, 4% propanediol, and 20% PEG 3350
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.232
|
|
9D4W
Structure of PAK1 in complex with compound 12
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2Q N~2~-{[(1s,4s)-4-aminocyclohexyl]methyl}-N~4~-[5-(trifluoromethyl)-1,3-thiazol-2-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;0.1 M Na-malonate buffer, pH 6.6 , 0.15 M DL-malic acid, 4% propanediol, and 20% PEG 3350
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.232
|
|
9D4X
Structure of PAK1 in complex with compound 16
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
250–545(296 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2S N~2~-{[(1R,3R,4S)-4-amino-3-(3-chlorophenyl)cyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;0.1 M Na-malonate buffer, pH 6.8 , 0.15 M DL-malic acid, 4% propanediol, and 20% PEG 3350
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.227
|
|
9D4X
Structure of PAK1 in complex with compound 16
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
250–545(296 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2S N~2~-{[(1R,3R,4S)-4-amino-3-(3-chlorophenyl)cyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;0.1 M Na-malonate buffer, pH 6.8 , 0.15 M DL-malic acid, 4% propanediol, and 20% PEG 3350
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.227
|
|
9D4Y
Structure of PAK1 in complex with compound 31
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
249–545(297 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2S N~2~-{[(1R,3R,4S)-4-amino-3-(3-chlorophenyl)cyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;100 mM malonate pH 6.6, 150 mM malic acid, 22% PEG 3350, 4% 1,2-propanediol
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.227
|
|
9D4Y
Structure of PAK1 in complex with compound 31
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
249–545(297 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2S N~2~-{[(1R,3R,4S)-4-amino-3-(3-chlorophenyl)cyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;100 mM malonate pH 6.6, 150 mM malic acid, 22% PEG 3350, 4% 1,2-propanediol
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.227
|
|
9D50
Structure of PAK1 in complex with compound 24
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
250–545(296 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2T 3-cyano-N-[3-({6-[(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)amino]pyrazin-2-yl}amino)bicyclo[1.1.1]pentan-1-yl]azetidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM malonate pH 6.6, 150 mM malic acid, 19% PEG 3350, 4% 1,2-propanediol
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.230
|
|
9D50
Structure of PAK1 in complex with compound 24
提交 2024-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
250–545(296 aa)
|
突变:D389N, T423E
|
A1A2T 3-cyano-N-[3-({6-[(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)amino]pyrazin-2-yl}amino)bicyclo[1.1.1]pentan-1-yl]azetidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM malonate pH 6.6, 150 mM malic acid, 19% PEG 3350, 4% 1,2-propanediol
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.230
|
|
9N48
Crystal structure of PAK1 bound to compound C1
提交 2025-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
链 B
249–545(297 aa)
|
未记录
|
A1BV1 (6M)-8-[2-(2-aminoethoxy)ethyl]-6-[2-chloro-3-fluoro-4-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]-2-(ethylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;0.2 M Lithium Sulfate, 0.1 M Tris pH8.5, 30% PEG4000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.216
|
|
9N4U
Crystal structure of PAK1 bound to compound R1
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
链 B
249–545(297 aa)
|
未记录
|
A1BV8 (3M)-3-[(4P)-2-chloro-4-(6-methylpyridin-2-yl)phenyl]-1-{2-[2-(dimethylamino)ethoxy]ethyl}-1,6-naphthyridin-2(1H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 30% PEG4000
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.203
|
|
9NBX
Crystal structure of PAK1 bound to C2
提交 2025-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
249–545(297 aa)
链 B
249–545(297 aa)
|
未记录
|
A1BW5 (6M)-8-(3-aminopropyl)-6-(4-butoxy-2-methylphenyl)-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris pH8.5, 30% PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.265
|