1zvp

Crystal Structure of a Protein of Unknown Function VC0802 from Vibrio cholerae, Possible Transport Protein

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息,但缺少统一蛋白身份时,不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly 物理组成 蛋白状态 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 2 / 0 / 0 / 0 与蛋白数一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1zvp
沉积日期 deposition_date2005-06-02
结构标题 titleCrystal Structure of a Protein of Unknown Function VC0802 from Vibrio cholerae, Possible Transport Protein
关键词 keywords;Vibrio cholerae, Structural Genomics, PSI, Protein Structure Initiative, Midwest Center for Structural Genomics, MCSG, UNKNOWN FUNCTION ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1zvp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1zvp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1zvp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.02 Å
Rg(电子密度)17.68 Å
总 Rg18.79 Å
原子数1948
残基数259
排除体积34961 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1zvp__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1zvp__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_idd1zvpa1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpa2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpc1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpc2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpc3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1zvpd1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like
结构域编号 domain_idd1zvpd2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.18 — ACT-like
家族 Family familyd.58.18.9 — VC0802-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1zvpA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2130 — VC0802-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — VC0802-like
结构域编号 domain_id1zvpB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2130 — VC0802-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — VC0802-like
结构域编号 domain_id1zvpC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2130 — VC0802-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — VC0802-like
结构域编号 domain_id1zvpD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2130 — VC0802-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — VC0802-like
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7. 引用文献 (1)