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1zw0

Crystal structure of the Yersinia Type III Secretion protein YscE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

type III secretion protein

Yersinia pestis

UniProt Q7ARI1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
10 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 water × 6 与蛋白数一致
11 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 water × 6 与蛋白数一致
12 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 water × 6 与蛋白数一致
13 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 water × 6 与蛋白数一致
14 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致
15 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 16 water × 16 与蛋白数一致
6 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 16 water × 16 与蛋白数一致
7 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 8 water × 8 与蛋白数一致
8 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 8 water × 8 与蛋白数一致
9 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 8 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
1zw0 1zw0 1zw0 1zw0

共 4 个 assembly

同源四聚体
1zw0 1zw0

共 2 个 assembly

其他同源多聚体
1zw0 1zw0 1zw0 1zw0 1zw0 1zw0 1zw0 1zw0 1zw0

共 9 个 assembly

异源或核酸复合物
2p58

共 1 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7ARI1_YERPE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 B； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 C； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 D； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 E； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 F； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 G； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 H； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1zw0
沉积日期 deposition_date2005-06-03
结构标题 titleCrystal structure of the Yersinia Type III Secretion protein YscE
关键词 keywordsType III secretion, chaperone, Yersinia, translocation, export; CHAPERONE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1zw0__assembly_9__model_1

Assembly 9 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1zw0__assembly_9__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1zw0__assembly_9__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）34.81 Å
Rg（电子密度）35.79 Å
总 Rg35.63 Å
原子数3712
残基数479
排除体积66600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1zw0__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1zw0__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1zw0__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 1zw0__assembly_4__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 1zw0__assembly_5__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 1zw0__assembly_6__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 1zw0__assembly_7__model_1 octameric （8） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 1zw0__assembly_8__model_1 octameric （8） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 1zw0__assembly_9__model_1 octameric （8） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 1zw0__assembly_10__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
11 1 1zw0__assembly_11__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
12 1 1zw0__assembly_12__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
13 1 1zw0__assembly_13__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
14 1 1zw0__assembly_14__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
15 1 1zw0__assembly_15__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1zw0A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0E00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0F00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0G00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
结构域编号 domain_id1zw0H00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily420 — Immunoglobulin FC, subunit C
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7. 引用文献 (1)