2a5w

Crystal structure of the oxidized gamma-subunit of the dissimilatory sulfite reductase (DsrC) from Archaeoglobus fulgidus

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

sulfite reductase, desulfoviridin-type subunit gamma (dsvC)

Archaeoglobus fulgidus

UniProt O28055

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 SULFATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 SULFATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SULFATE ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O28055_ARCFU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–115; UniProt 1–115 作者链 B; PDB构建体 1–115; UniProt 1–115 作者链 C; PDB构建体 1–115; UniProt 1–115

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2a5w
沉积日期 deposition_date2005-07-01
结构标题 titleCrystal structure of the oxidized gamma-subunit of the dissimilatory sulfite reductase (DsrC) from Archaeoglobus fulgidus
关键词 keywordsorthogonal helix bundle, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2a5w__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2a5w__assembly_4__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2a5w__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.23 Å
Rg(电子密度)19.37 Å
总 Rg20.23 Å
原子数1892
残基数228
排除体积33913 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2a5w__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2a5w__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 2a5w__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 2a5w__assembly_4__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd2a5wa_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.203 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
超家族 Superfamily superfamilyd.203.1 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
家族 Family familyd.203.1.1 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
结构域编号 domain_idd2a5wb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.203 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
超家族 Superfamily superfamilyd.203.1 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
家族 Family familyd.203.1.1 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
结构域编号 domain_idd2a5wc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.203 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
超家族 Superfamily superfamilyd.203.1 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase
家族 Family familyd.203.1.1 — DsrC, the gamma subunit of dissimilatory sulfite reductase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id2a5wA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1420 — Dissimilatory Siroheme-sulfite Reductase; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DsrC protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2a5wA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily370 — DsrC protein, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2a5wB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1420 — Dissimilatory Siroheme-sulfite Reductase; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DsrC protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2a5wB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily370 — DsrC protein, C-terminal domain
结构域编号 domain_id2a5wC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1420 — Dissimilatory Siroheme-sulfite Reductase; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DsrC protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2a5wC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily370 — DsrC protein, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)