SAXSdb — 2aff

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antigen KI-67

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–120	片段：FHA domain	MKI67 FHA domain interacting nucleolar phosphoprotein × 1 （Q9BYG3）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成：0.9 mM Ki67 FHA U-15N,13C; 1 mM hNIFK(226-269)3P unlabeled 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成：0.9 mM Ki67 FHA U-15N,13C; 1 mM hNIFK(226-269)3P unlabeled 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 100% D2O NMR样品组成：1 mM Ki67 FHA unlabled; 0.9 mM hNIFK(226-269)3P U-15N,13C 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成：1 mM Ki67 FHA unlabled; 0.9 mM hNIFK(226-269)3P U-15N,13C 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2AFF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1R21 Solution Structure of human Ki67 FHA Domain 提交 2003-09-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：FHA domain	突变：none	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 8.4；290 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.5；290 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM U-13C,15N-protein; 10 mM TrisHCl buffer (pH 8.4); 2mM DTT; 1 mM EDTA \| 95% H2O, 10% D2O NMR样品组成 0.5 mM U-13C,15N-protein; 5 mM HEPES buffer (pH 7.5); 2mM DTT; 1 mM EDTA; 150 mM NaCl \| 95% H2O, 10% D2O NMR样品组成 0.5 mM unlabeled-protein; 10 mM TrisHCl buffer (pH 8.4); 2mM DTT; 1 mM EDTA \| 95% H2O, 10% D2O NMR样品组成 0.5 mM unlabeled-protein; 10 mM TrisHCl buffer (pH 8.4); 2mM DTT; 1 mM EDTA \| 100% D2O	分辨率未提供
5J28 Ki67-PP1g (protein phosphatase 1, gamma isoform) holoenzyme complex 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 496–536（41 aa）片段：UNP residues 496-536	突变：T525M	MLI MALONATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；1.9 M Sodium Malonate pH 4.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.197
5J28 Ki67-PP1g (protein phosphatase 1, gamma isoform) holoenzyme complex 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 496–536（41 aa）片段：UNP residues 496-536	突变：T525M	MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；1.9 M Sodium Malonate pH 4.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.197

共 2 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KI67_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120

MKI67 FHA domain interacting nucleolar phosphoprotein

Homo sapiens

UniProt Q9BYG3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 226–269	片段：residues 226-269 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Antigen KI-67 × 1 （P46013）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成：0.9 mM Ki67 FHA U-15N,13C; 1 mM hNIFK(226-269)3P unlabeled 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成：0.9 mM Ki67 FHA U-15N,13C; 1 mM hNIFK(226-269)3P unlabeled 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 100% D2O NMR样品组成：1 mM Ki67 FHA unlabled; 0.9 mM hNIFK(226-269)3P U-15N,13C 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成：1 mM Ki67 FHA unlabled; 0.9 mM hNIFK(226-269)3P U-15N,13C 5 mM HEPES, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, pH 7.4 \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2AFF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8FKP Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.	分辨率 2.85 Å
8FKQ Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 51 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.76 Å
8FKR Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.89 Å
8FKS Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 61 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.88 Å
8FKT Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 64 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.81 Å
8FKU Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 58 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.82 Å
8FKV Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 65 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.47 Å
8FKW Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 59 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.50 Å
8FKX Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State E) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 61 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.59 Å
8FKY Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State F) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：59-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 70 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.67 Å
8FKZ Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State G) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 64 ZN ZINC ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 3.04 Å
8FL2 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：65-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 100 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.67 Å
8FL3 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：63-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 100 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.53 Å
8FL6 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.62 Å
8FL7 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.55 Å
8FLA Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.63 Å
8FLB Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 88 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.	分辨率 2.55 Å
8FLD Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L1) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.	分辨率 2.58 Å
8FLE Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L2) 提交 2022-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric	链 SH 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.	分辨率 2.48 Å
8INE human nuclear pre-60S ribosomal particle - State G' 提交 2023-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 t 1–293（293 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8INF human nuclear pre-60S ribosomal particle - State F' 提交 2023-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric	链 t 1–293（293 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8IPX human nuclear pre-60S ribosomal particle - State C' 提交 2023-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 t 1–293（293 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8IPY human nuclear pre-60S ribosomal particle - State D' 提交 2023-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 t 1–293（293 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8IR3 human nuclear pre-60S ribosomal particle - State B' 提交 2023-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 t 1–293（293 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MK67I_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–44； UniProt 226–269

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2aff
沉积日期 deposition_date	2005-07-25
结构标题 title	The solution structure of the Ki67FHA/hNIFK(226-269)3P complex
关键词 keywords	Ki67; FHA; NIFK; NMR; Phosphoprotein, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	15.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	14.70 Å
零角强度 I(0) i0	37653700000.00
分子量 molecular_weight	1584200.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1953000 Å³
包络体积 envelope_volume	33045 Å³
水化壳体积 shell_volume	16663 Å³
包络直径 envelope_diameter	55.5 Å
壳层 Rg shell_rg	22.72 Å
包络 Rg envelope_rg	16.81 Å
形状 Rg shape_rg	14.69 Å
总 Rg total_rg	14.77 Å
总原子数 total_atoms	220300
残基数 n_residues	13500
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	48.4 Å
Rg (实空间) rg_real	15.05 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.36 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7650e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.7720e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	15.06 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	37650000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8897
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	20.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.145
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.304
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	383400.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.993

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Antigen KI-67
分子量 formula_weight	13826.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	220300

MWPTRRLVTIKRSGVDGPHFPLSLSTCLFGRGIECDIRIQLPVVSKQHCKIEIHEQEAILHNFSSTNPTQVNGSVIDEPVRLKHGDVITIIDRSFRYENESLQNGRKSTEFPRKIREQEP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MKI67 FHA domain interacting nucleolar phosphoprotein
分子量 formula_weight	5197.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

KTVDSQGPTPVCTPTFLERRKSQVAELNDDDKDDEIVFKQPISC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2affa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamily	b.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family family	b.26.1.2 — FHA domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2affA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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8. 引用文献 (2)

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fit	/app/data/saxs_computation/af/2aff/2aff.fit
pddf	/app/data/pr_computation/af/2aff/2aff.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/af/2aff/2aff.dat

The solution structure of the Ki67FHA/hNIFK(226-269)3P complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Antigen KI-67

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MKI67 FHA domain interacting nucleolar phosphoprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)