Cytochrome c-552
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 19–98 | 未记录 | HEC HEME C × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM ACETATE BUFFER；压力 1 NMR样品组成：2mM CYTOCHROME C-552 | 90% H2O/10% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2AI5 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AYG SOLUTION STRUCTURE OF CYTOCHROME C-552, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-11-04 | 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
19–98（80 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM ACETATE；压力 1
NMR样品组成
90% H2O/10% D2O, OR 99.98% D2O CONTAINING 120MM DEUTERATED ACETATE BUFFER
|
分辨率未提供 |
| 1YNR Crystal structure of the cytochrome c-552 from Hydrogenobacter thermophilus at 2.0 resolution 提交 2005-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
19–98（80 aa）
链 B
19–98（80 aa）
链 C
19–98（80 aa）
链 D
19–98（80 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 HEC HEME C × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；MPD, ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 3VYM Dimeric Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 提交 2012-09-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
19–98（80 aa）
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未记录 | HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；100mM HEPES buffer, 800mM ammonium sulfate, 45% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.264 |
| 4ZID Dimeric Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 obtained from Escherichia coli 提交 2015-04-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
19–98（80 aa）
片段：UNP residues 19-98
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未记录 | HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.6 M sodium citrate buffer
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.203 |
| 5AUR Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 dimer formed by domain swapping at N-terminal region 提交 2015-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
19–98（80 aa）
链 C
19–98（80 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 2 IOD IODIDE ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；200 mM potassium iodide, 15% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.229 |
| 5AUR Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 dimer formed by domain swapping at N-terminal region 提交 2015-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
19–98（80 aa）
链 G
19–98（80 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 2 IOD IODIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；200 mM potassium iodide, 15% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.229 |
| 5AUS Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 dimer formed by domain swapping at C-terminal region 提交 2015-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
19–98（80 aa）
链 C
19–98（80 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris-HCl, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG 4000
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分辨率 1.30 Å R-free 0.202 |
| 5XEC Heterodimer constructed from PA cyt c551-HT cyt c552 and HT cyt c552-PA cyt c551 chimeric proteins 提交 2017-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–98（62 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-42,UNP RESIDUES 37-98
链 C
19–36（18 aa）
片段：UNP RESIDUES 19-36,UNP RESIDUES 43-104
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未记录 | HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris-HCl containing 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.197 |
| 5XED Heterodimer constructed from M61A PA cyt c551-HT cyt c552 and HT cyt c552-PA cyt c551 chimeric proteins 提交 2017-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
37–98（62 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-42,UNP RESIDUES 37-98
链 C
19–36（18 aa）
片段：UNP RESIDUES 19-36,UNP RESIDUES 43-104
|
突变：M61A | HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM MES containing 25% w/v PEG 6000
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分辨率 1.55 Å R-free 0.238 |
共 8 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CY552_HYDTH |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–80； UniProt 19–98 |
