Human immunodeficiency virus type 1 (BH5 ISOLATE)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | DIMETHYL SULFOXIDE × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 1 N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 GLYCEROL × 3 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POL_HV1B5 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 69–167 作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 69–167 |
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| 条目编号 entry_id | 2aod |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-08-12 |
| 结构标题 title | Crystal structure analysis of HIV-1 protease with a substrate analog P2-NC |
| 关键词 keywords | HIV-1 PROTEASE, MUTANT, DIMER, SUBSTRATE ANALOG, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2aod__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 排除 | — | — |
| 排除原因： 来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。 | ||||||
| 结构域编号 domain_id | d2aoda_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | d2aodb_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | 2aodA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 2aodB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |