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2aog

Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant V82A with a substrate analog P2-NC

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HIV-1 PROTEASE (RETROPEPSIN)

Human immunodeficiency virus type 1 (BH5 ISOLATE)

UniProt P04587

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 69–167 链 B； UniProt 69–167 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, V82A, C95A 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 GOL GLYCEROL × 5 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；SODIUM CHLORIDE 0.4M, DMSO 5%,CITRATE PHOSPHATE BUFFER, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K 分辨率 1.10 Å R-free 0.166

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2AOG Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BDL HIV-1 (2:31-37) PROTEASE COMPLEXED WITH INHIBITOR SB203386 提交 1998-05-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：T31S, V32I, L33V, E34A, E35G, M36I, S37E 突变：T31S, V32I, L33V, E34A, E35G, M36I, S37E IM1 (2R,4S,5S,1'S)-2-PHENYLMETHYL-4-HYDROXY-5-(TERT-BUTOXYCARBONYL)AMINO-6-PHENYL HEXANOYL-N-(1'-IMIDAZO-2-YL)-2'-METHYLPROPANAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, BY MIXING EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND SAMPLE, 21 DEGREES C. RESERVOIR: 10% PEG-1000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M MES, PH 6.0. SAMPLE: 3.5 MG/ML PROTEIN/INHIBITOR COMPLEX AT 1:5 MOLAR RATIO., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
1BDQ HIV-1 (2:31-37, 47, 82) PROTEASE COMPLEXED WITH INHIBITOR SB203386 提交 1998-05-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：T31S, V32I, L33V, E34A, E35G, M36I, S37E, I47V, V82I 突变：T31S, V32I, L33V, E34A, E35G, M36I, S37E, I47V, V82I IM1 (2R,4S,5S,1'S)-2-PHENYLMETHYL-4-HYDROXY-5-(TERT-BUTOXYCARBONYL)AMINO-6-PHENYL HEXANOYL-N-(1'-IMIDAZO-2-YL)-2'-METHYLPROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, BY MIXING EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND SAMPLE, 21 DEGREES C. RESERVOIR: 35% 3.5 MG/ML PROTEIN/INHIBITOR COMPLEX AT 1:5 MOLAR RATIO., pH 5.6, vapor diffusion - hanging drop, temperature 294K
分辨率 2.50 Å R-free 0.261
1BDR HIV-1 (2: 31, 33-37) PROTEASE COMPLEXED WITH INHIBITOR SB203386 提交 1998-05-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：T31S, L33V, E34T, E35G, M36I, S37E 突变：T31S, L33V, E34T, E35G, M36I, S37E IM1 (2R,4S,5S,1'S)-2-PHENYLMETHYL-4-HYDROXY-5-(TERT-BUTOXYCARBONYL)AMINO-6-PHENYL HEXANOYL-N-(1'-IMIDAZO-2-YL)-2'-METHYLPROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；294 K；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, BY MIXING EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND SAMPLE, 21 DEG. C RESERVOIR: 28% 3.5 MG/ML PROTEIN/INHIBITOR COMPLEX AT 1:5 MOLAR RATIO., pH 5.2, vapor diffusion - hanging drop, temperature 294K
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
1FEJ STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE: HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES 提交 2000-07-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：L90M 突变：L90M 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE 25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML, pH 5.0-6.5. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.78 Å R-free 0.285
1FF0 STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE: HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES. 提交 2000-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：K45I 突变：K45I 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE 25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML. pH 5.0-6.5 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.232
1FFF STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE : HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES. 提交 2000-07-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：D30N 突变：D30N 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE 25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML, pH 5-6.5. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.248
1FFI STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE: HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES 提交 2000-07-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：D30N 突变：D30N 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHAT25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML, pH 5-6.5. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.252
1FG6 STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE: HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES 提交 2000-07-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：N88D 突变：N88D 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHAT25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML, pH 5.0-6.5. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.248
1FG8 STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE: HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES 提交 2000-07-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：N88D 突变：N88D 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHAT25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML, pH 5.0-6.5. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.267
1FGC STRUCTURAL IMPLICATIONS OF DRUG RESISTANT MUTANTS OF HIV-1 PROTEASE: HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF THE MUTANT PROTEASE/SUBSTRATE ANALOG COMPLEXES 提交 2000-07-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa）
链 D 69–167（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHAT25-50%, PROTEIN 2-5 MG/ML, pH 5.0-6.5. VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.268
1G2K HIV-1 PROTEASE WITH CYCLIC SULFAMIDE INHIBITOR, AHA047 提交 2000-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：RESIDUES 1-99
链 B 69–167（99 aa） 片段：RESIDUES 1-99
未记录 NM1 3-(7-BENZYL-4,5-DIHYDROXY-1,1-DIOXO-3,6-BIS-PHENOXYMETHYL-1L6-[1,2,7]THIADIAZEPAN-2-YLMETHYL)-N-METHYL-BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES, 0.4 M NaCl, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.240
1HPV CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH VX-478, A POTENT AND ORALLY BIOAVAILABLE INHIBITOR OF THE ENZYME 提交 1994-11-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1HVJ INFLUENCE OF STEREOCHEMISTRY ON ACTIVITY AND BINDING MODES FOR C2 SYMMETRY-BASED DIOL INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-01-26 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 A78 N-{1-BENZYL-3-HYDROXY-4-[3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRYLAMINO]-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
1HVS STRUCTURAL BASIS OF DRUG RESISTANCE FOR THE V82A MUTANT OF HIV-1 PROTEASE: BACKBONE FLEXIBILITY AND SUBSITE REPACKING 提交 1994-11-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 A77 N-{1-BENZYL-(2R,3S)-2,3-DIHYDROXY-4-[3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRYLAMINO]-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.25 Å
1K1T Combining Mutations in HIV-1 Protease to Understand Mechanisms of Resistance 提交 2001-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa）
链 B 500–598（99 aa）
突变：K45I, V82S 突变：K45I, V82S 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-50% Saturated Ammonium Sulphate, 10% DMSO, 0.25M citrate/0.5M phosphate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.20 Å R-free 0.227
1K1U Combining Mutations in HIV-1 Protease to Understand Mechanisms of Resistance 提交 2001-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, l33I, K45I, L63I, C67A, L90M, C95A 突变：Q7K, l33I, K45I, L63I, C67A, L90M, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-50% Saturated Ammonium Sulphate, 10% DMSO, 0.25M citrate/0.5M phosphate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.55 Å R-free 0.265
1K2B Combining Mutations in HIV-1 Protease to Understand Mechanisms of Resistance 提交 2001-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, l33I, L63I, C67A, C95A, N88D, L90M 突变：Q7K, l33I, L63I, C67A, C95A, N88D, L90M 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-50% Saturated Ammonium Sulphate, 10% DMSO, 0.25M citrate/0.5M phosphate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.278
1K2C Combining Mutations in HIV-1 Protease to Understand Mechanisms of Resistance 提交 2001-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：D30N, V82S, Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：D30N, V82S, Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-50% Saturated Ammonium Sulphate, 10% DMSO, 0.25M citrate/0.5M phosphate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.299
1Q9P Solution structure of the mature HIV-1 protease monomer 提交 2003-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 501–595（95 aa）
突变：Q507K, L533I, L563I, C567A, C595A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM HIV-1 protease u-15N, 13C, 20mM phosphate buffer, 95% H2O, 5%D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1TCX HIV TRIPLE MUTANT PROTEASE COMPLEXED WITH INHIBITOR SB203386 提交 1996-06-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：I32V, V47I, I82V 突变：I32V, V47I, I82V IM1 (2R,4S,5S,1'S)-2-PHENYLMETHYL-4-HYDROXY-5-(TERT-BUTOXYCARBONYL)AMINO-6-PHENYL HEXANOYL-N-(1'-IMIDAZO-2-YL)-2'-METHYLPROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1WJE SOLUTION STRUCTURE OF H12C MUTANT OF THE N-TERMINAL ZN BINDING DOMAIN OF HIV-1 INTEGRASE COMPLEXED TO CADMIUM, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 728–773（46 aa）
突变：H12C CD CADMIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5；308 K
分辨率未提供
1WJF SOLUTION STRUCTURE OF H12C MUTANT OF THE N-TERMINAL ZN BINDING DOMAIN OF HIV-1 INTEGRASE COMPLEXED TO CADMIUM, NMR, 40 STRUCTURES 提交 1998-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 728–782（55 aa）
突变：H12C CD CADMIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5；308 K
分辨率未提供
2AOC Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant I84V with a substrate analog P2-NC 提交 2005-08-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A UNX UNKNOWN LIGAND × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 GOL GLYCEROL × 2 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；SODIUM CHLORIDE 0.4M, DMSO 5%, CITRATE PHOSPHATE BUFFER PH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.30 Å R-free 0.166
2AOD Crystal structure analysis of HIV-1 protease with a substrate analog P2-NC 提交 2005-08-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；AMMONIUM SULFATE 17%, CITRATE PHOSPHATE BUFFER PH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.196
2AOE crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant V82A with a substrate analog CA-P2 提交 2005-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 69–167（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：YES 突变：YES NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 3 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；SODIUM CHLORIDE 1.3M, DMSO 7%,SODIUM ACETATE BUFFER, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.54 Å R-free 0.198
2AOF Crystal structure analysis of HIV-1 Protease mutant V82A with a substrate analog P1-P6 提交 2005-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 69–167（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：YES 突变：YES NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；SODIUM CHLORIDE 0.8M, DMSO 5%,SODIUM ACETATE BUFFER, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.32 Å R-free 0.184
2AOH Crystal structure analysis of HIV-1 Protease mutant V82A with a substrate analog P6-PR 提交 2005-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 69–167（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：YES 突变：YES NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；AMMONIUM SULFATE 30%, DMSO 7%,SODIUM ACETATE BUFFER, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.42 Å R-free 0.233
2AOI Crystal structure analysis of HIV-1 protease with a substrate analog P1-P6 提交 2005-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：YES 突变：YES SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；AMMONIUM SULFATE 10%, DMSO 5%,SODIUM ACETATE BUFFER, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.210
2AOJ Crystal structure analysis of HIV-1 protease with a substrate analog P6-PR 提交 2005-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：YES 突变：YES DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ACY ACETIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；AMMONIUM SULFATE 27%, DMSO 7%,SODIUM ACETATE BUFFER, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.60 Å R-free 0.229
2AVM Kinetics, stability, and structural changes in high resolution crystal structures of HIV-1 protease with drug resistant mutations L24I, I50V, AND G73S 提交 2005-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：Protease Retropepsin
链 B 69–167（99 aa） 片段：Protease Retropepsin
未记录 GOL GLYCEROL × 3 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, PH 5.8,SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 5-10%,DMSO 13%, pH 5.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.10 Å R-free 0.132
2AVO Kinetics, stability, and structural changes in high resolution crystal structures of HIV-1 protease with drug resistant mutations L24I, I50V, AND G73S 提交 2005-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：protease retropepsin
链 B 69–167（99 aa） 片段：protease retropepsin
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 ACY ACETIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, PH 5.2, SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 25%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 5.20, temperature 295.0K
分辨率 1.10 Å R-free 0.138
2AVQ Kinetics, stability, and structural changes in high resolution crystal structures of HIV-1 protease with drug resistant mutations L24I, I50V, AND G73S 提交 2005-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：RETROPEPSIN
链 B 69–167（99 aa） 片段：RETROPEPSIN
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 2NC N-{(2S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl-L-isoleucyl)amino]hexyl}-L-norleucyl-L-glutaminyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, PH 5.8,SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 15-20%,DMSO 10%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.30 Å R-free 0.144
2AVS kinetics, stability, and structural changes in high resolution crystal structures of HIV-1 protease with drug resistant mutations L24I, I50V, and G73S 提交 2005-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：retropepsin
链 B 69–167（99 aa） 片段：retropepsin
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 ACY ACETIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, PH 5.8, SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 30-35%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.10 Å R-free 0.141
2AVV Kinetics, stability, and structural changes in high resolution crystal structures of HIV-1 protease with drug resistant mutations L24I, I50V, and G73S 提交 2005-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：RETROPEPSIN
链 B 69–167（99 aa） 片段：RETROPEPSIN
未记录 MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 ACY ACETIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, PH 6.0, SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 40%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
2AVV Kinetics, stability, and structural changes in high resolution crystal structures of HIV-1 protease with drug resistant mutations L24I, I50V, and G73S 提交 2005-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 69–167（99 aa） 片段：RETROPEPSIN
链 E 69–167（99 aa） 片段：RETROPEPSIN
未记录 MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, PH 6.0, SATURATED AMMONIUM SULPHATE, 40%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
2BPV HIV-1 protease-inhibitor complex 提交 1998-01-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 1IN 1-[2-HYDROXY-4-(2-HYDROXY-5-METHYL-CYCLOPENTYLCARBAMOYL)5-PHENYL-PENTYL]-4-(3-PYRIDIN-3-YL-PROPIONYL)-PIPERAZINE-2-CARB OXYLIC ACID TERT-BUTYLAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
2BPW HIV-1 protease-inhibitor complex 提交 1998-01-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 1IN 1-[2-HYDROXY-4-(2-HYDROXY-5-METHYL-CYCLOPENTYLCARBAMOYL)5-PHENYL-PENTYL]-4-(3-PYRIDIN-3-YL-PROPIONYL)-PIPERAZINE-2-CARB OXYLIC ACID TERT-BUTYLAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
2BPX HIV-1 protease-inhibitor complex 提交 1998-01-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
2BPY HIV-1 protease-inhibitor complex 提交 1998-01-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 3IN N-[2(S)-CYCLOPENTYL-1(R)-HYDROXY-3(R)METHYL]-5-[(2(S)-TERTIARY-BUTYLAMINO-CARBONYL)-4-(N1-(2)-(N-METHYLPIPERAZINYL)-3-CHLORO-PYRAZINYL-5-CARBONYL)-PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYL-PENTANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
2BPZ HIV-1 protease-inhibitor complex 提交 1998-01-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 3IN N-[2(S)-CYCLOPENTYL-1(R)-HYDROXY-3(R)METHYL]-5-[(2(S)-TERTIARY-BUTYLAMINO-CARBONYL)-4-(N1-(2)-(N-METHYLPIPERAZINYL)-3-CHLORO-PYRAZINYL-5-CARBONYL)-PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYL-PENTANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
2F80 HIV-1 Protease mutant D30N complexed with inhibitor TMC114 提交 2005-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：Q7K, D30N, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, D30N, L33I, L63I, C67A, C95A CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；NaOAc buffer (pH = 4.6), 1% DMSO, 0.5% dioxane and 10% NaCl as a precipitating agent, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.218
2F80 HIV-1 Protease mutant D30N complexed with inhibitor TMC114 提交 2005-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：Q7K, D30N, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, D30N, L33I, L63I, C67A, C95A CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；NaOAc buffer (pH = 4.6), 1% DMSO, 0.5% dioxane and 10% NaCl as a precipitating agent, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.218
2F81 HIV-1 Protease mutant L90M complexed with inhibitor TMC114 提交 2005-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；NaoAc buffer (pH = 4.2), and 5% NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.25 Å R-free 0.189
2F8G HIV-1 protease mutant I50V complexed with inhibitor TMC114 提交 2005-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
链 B 500–598（99 aa） 片段：PROTEASE (RETROPEPSIN)
突变：Q7K, L33I, I50V, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I50V, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ACY ACETIC ACID × 2 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；NaOAc buffer (pH = 4.8), 2% DMSO, 0.5% dioxane, and 10% NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.22 Å R-free 0.188
2NMY Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant V82A with a inhibitor saquinavir 提交 2006-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa）
链 B 500–598（99 aa）
突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,V581A,C594A 突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,V581A,C594A CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；SODIUM CHLORIDE 0.6M, DMSO 10%, SODIUM ACETATE BUFFER PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.10 Å R-free 0.181
2NMZ Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant V82A with a inhibitor saquinavir 提交 2006-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa）
链 B 500–598（99 aa）
突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,V581A,C594A 突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,V581A,C594A SO4 SULFATE ION × 3 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；AMMONIUM SULFATE 40%, CITRATE PHOSPHATE BUFFER PH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 0.97 Å R-free 0.144
2NNK Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant I84V with a inhibitor saquinavir 提交 2006-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa）
链 B 500–598（99 aa）
突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,I583V,C594A 突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,I583V,C594A NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；NACL 1.6M, SODIUM ACETATE BUFFER, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.25 Å R-free 0.187
2NNP Crystal structure analysis of HIV-1 protease mutant I84V with a inhibitor saquinavir 提交 2006-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa）
链 B 500–598（99 aa）
突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,I583V,C594A 突变：Q506K,L532I,L562I,C566A,I583V,C594A ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 ACY ACETIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；AMMONIUM SULFATE 26%, CITRATE PHOSPHATE BUFFER, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.20 Å R-free 0.199
2Z54 The Influence of I47A Mutation on Reduced Susceptibility to the Protease Inhibitor Lopinavir 提交 2007-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
突变：I47A 突变：I47A BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 AB1 N-{1-BENZYL-4-[2-(2,6-DIMETHYL-PHENOXY)-ACETYLAMINO]-3-HYDROXY-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(2-OXO-TETRAHYDRO-PYRIMIDIN-1-YL)-BUTYRAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.31 Å R-free 0.254
3B7V HIV-1 protease complexed with gem-diol-amine tetrahedral intermediate NLLTQI 提交 2007-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
突变：K507Q, I533L, I563L, A567C, A595C 突变：K507Q, I533L, I563L, A567C, A595C NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；50mM sodium phosphate/100mM sodium citrate, 10% NaCl (w/w), 2.5% glycerol (v/v), pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.46 Å R-free 0.212
3B80 HIV-1 protease mutant I54V complexed with gem-diol-amine intermediate NLLTQI 提交 2007-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
突变：Q507K, L533I, I554V, L563I, C567A, C595A 突变：Q507K, L533I, I554V, L563I, C567A, C595A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；12.5mM sodium phosphate/50mM sodium citrate buffer, 8% NaCl (w/w), 10% glycerol (v/v), pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.219
3CYW Effect of Flap Mutations on Structure of HIV-1 Protease and Inhibition by Saquinavir and Darunavir 提交 2008-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：G48V 突变：G48V CL CHLORIDE ION × 5 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER, KCl, 1.3M, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.40 Å R-free 0.234
3CYX Crystal structure of HIV-1 mutant I50V and inhibitor saquinavira 提交 2008-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：I50V 突变：I50V ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 NA SODIUM ION × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；PHOSPHATE BUFFEr, 30-35% SATURATED AMMONIUM SULPHATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.20 Å R-free 0.192
3D1X Crystal structure of HIV-1 mutant I54M and inhibitor saquinavir 提交 2008-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：I54M 突变：I54M CL CHLORIDE ION × 3 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；SODIUM ACETATE BUFFER, 10-15% NaCl, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.05 Å R-free 0.147
3D1Y Crystal structure of HIV-1 mutant I54V and inhibitor SAQUINA 提交 2008-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：I54V 突变：I54V NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；SODIUM ACETATE BUFFER, 1M NaCl, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.05 Å R-free 0.174
3D1Z Crystal structure of HIV-1 mutant I54M and inhibitor DARUNAVIR 提交 2008-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：I54M 突变：I54M CL CHLORIDE ION × 3 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；SODIUM ACETATE BUFFER, 20-25% NaCl, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.30 Å R-free 0.174
3D20 Crystal structure of HIV-1 mutant I54V and inhibitor DARUNAVIA 提交 2008-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A, I54V 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A, I54V NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.2M SODIUM ACETATE, PHOSPHATE BUFFER, 30% AMmONIUM SULFATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.05 Å R-free 0.180
6B36 Crystal Structure of HIV Protease complexed with (S)-N-(3-fluoro-2-(2-(1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl)ethyl)phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide 提交 2017-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 CKD (S)-N-(3-fluoro-2-(2-(1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl)ethyl)phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate, pH 5.0-5.5 300-500mM NaCl
分辨率 1.63 Å R-free 0.202
6B38 Crystal Structure of HIV Protease complexed with N-(3-fluoro-2-(2-((2S,6R)-6-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl)ethyl)phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide 提交 2017-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 CKM N-(3-fluoro-2-{2-[(2S,6R)-6-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl]ethyl}phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate pH 5.0-5.5 300-500 mM NaCl
分辨率 1.48 Å R-free 0.196
6B3C Crystal Structure of HIV Protease complexed with N-(3-fluoro-2-(2-((2S,6R)-6-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl)ethyl)phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide 提交 2017-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 CKS N-(3-fluoro-2-{2-[(2S,5R)-5-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl]ethyl}phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate pH 5.0-5.5 300-500 mM NaCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6B3F Crystal Structure of HIV Protease complexed with N-(3-fluoro-2-(2-((2S,5S)-5-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl)ethyl)phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide 提交 2017-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 CKV N-(3-fluoro-2-{2-[(2S,5S)-5-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl]ethyl}phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate pH 5.0-5.5 300-500 mM NaCl
分辨率 1.46 Å R-free 0.196
6B3G Crystal Structure of HIV Protease complexed with N-(3-fluoro-2-(2-((2S,6S)-6-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl)ethyl)phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide 提交 2017-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 CKY N-(3-fluoro-2-{2-[(2S,6S)-6-methyl-1-(phenylsulfonyl)piperazin-2-yl]ethyl}phenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate pH 5.0-5.5 300-500 mM NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.202
6B3H Crystal Structure of HIV Protease complexed with N-(2-(2-((6R,9S)-2,2-dioxido-2-thia-1,7-diazabicyclo[4.3.1]decan-9-yl)ethyl)-3-fluorophenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide 提交 2017-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CN4 N-(2-{2-[(6R,9S)-2,2-dioxo-2lambda~6~-thia-1,7-diazabicyclo[4.3.1]decan-9-yl]ethyl}-3-fluorophenyl)-3,3-bis(4-fluorophenyl)propanamide × 2 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100 mM sodium acetate pH 5.0-5.5 300-500 mM NaCl
分辨率 1.62 Å R-free 0.199

共 61 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POL_HV1B5
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 69–167 作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 69–167

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2aog
沉积日期 deposition_date2005-08-12
结构标题 titleCrystal structure analysis of HIV-1 protease mutant V82A with a substrate analog P2-NC
关键词 keywordsHIV-1 PROTEASE, MUTANT, DIMER, SUBSTRATE ANALOG, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2aoga_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.50 — Acid proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.50.1 — Acid proteases
家族 Family familyb.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin)
结构域编号 domain_idd2aogb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.50 — Acid proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.50.1 — Acid proteases
家族 Family familyb.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2aogA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Acid Proteases
结构域编号 domain_id2aogB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Acid Proteases
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (0)