← 返回搜索
2av9

Crystal Structure of the PA5185 protein from Pseudomonas Aeruginosa Strain PAO1.

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thioesterase

Pseudomonas aeruginosa

UniProt Q9HU04

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 SULFATE ION × 5 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 SULFATE ION × 4 water × 3 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 SULFATE ION × 6 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体
2av9 2av9 2av9 2o5u 2o5u 2o6b 2o6t 2o6t 2o6t 2o6u

共 10 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9HU04_PSEAE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 B； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 C； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 D； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 E； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 F； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 G； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 H； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 I； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 J； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 K； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147 作者链 L； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2av9
沉积日期 deposition_date2005-08-29
结构标题 titleCrystal Structure of the PA5185 protein from Pseudomonas Aeruginosa Strain PAO1.
关键词 keywordsthioesterase, structural genomics, PSI, Protein Structure Initiative, Midwest Center for Structural Genomics, MCSG, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2av9__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2av9__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2av9__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）23.98 Å
Rg（电子密度）22.85 Å
总 Rg23.79 Å
原子数4166
残基数550
排除体积73546 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2av9__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2av9__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 2av9__assembly_3__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_idd2av9a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9c_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9d_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9e_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9f_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9g_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9h_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9i_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9j_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9k_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like
结构域编号 domain_idd2av9l_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.38 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
超家族 Superfamily superfamilyd.38.1 — Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
家族 Family familyd.38.1.1 — 4HBT-like

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id2av9A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9E00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9F00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9G00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9H00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9I00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9J00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9K00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
结构域编号 domain_id2av9L00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology129 — Thiol Ester Dehydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hotdog Thioesterase
▶

7. 引用文献 (1)