2ayi

Wild-type AmpT from Thermus thermophilus

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aminopeptidase T

Thermus thermophilus

UniProt P42778

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ZINC ION × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ZINC ION × 4 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ZINC ION × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AMPT_THET8
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–408; UniProt 1–408 作者链 B; PDB构建体 1–408; UniProt 1–408 作者链 C; PDB构建体 1–408; UniProt 1–408 作者链 D; PDB构建体 1–408; UniProt 1–408 作者链 E; PDB构建体 1–408; UniProt 1–408

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ayi
沉积日期 deposition_date2005-09-07
结构标题 titleWild-type AmpT from Thermus thermophilus
关键词 keywordsaminopeptidase, metallopeptidase, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ayi__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ayi__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ayi__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)33.27 Å
Rg(电子密度)32.64 Å
总 Rg33.06 Å
原子数6190
残基数794
排除体积109670 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ayi__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2ayi__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 2ayi__assembly_3__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd2ayia1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.60 — Thermophilic metalloprotease-like
超家族 Superfamily superfamilye.60.1 — Thermophilic metalloprotease-like
家族 Family familye.60.1.1 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_idd2ayib1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.60 — Thermophilic metalloprotease-like
超家族 Superfamily superfamilye.60.1 — Thermophilic metalloprotease-like
家族 Family familye.60.1.1 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_idd2ayic1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.60 — Thermophilic metalloprotease-like
超家族 Superfamily superfamilye.60.1 — Thermophilic metalloprotease-like
家族 Family familye.60.1.1 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_idd2ayid1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.60 — Thermophilic metalloprotease-like
超家族 Superfamily superfamilye.60.1 — Thermophilic metalloprotease-like
家族 Family familye.60.1.1 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_idd2ayie1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.60 — Thermophilic metalloprotease-like
超家族 Superfamily superfamilye.60.1 — Thermophilic metalloprotease-like
家族 Family familye.60.1.1 — Thermophilic metalloprotease (M29)

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id2ayiA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1830 — Thermophilic metalloprotease-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_id2ayiB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1830 — Thermophilic metalloprotease-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_id2ayiC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1830 — Thermophilic metalloprotease-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_id2ayiD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1830 — Thermophilic metalloprotease-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thermophilic metalloprotease (M29)
结构域编号 domain_id2ayiE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1830 — Thermophilic metalloprotease-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thermophilic metalloprotease (M29)
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7. 引用文献 (1)