2b25

Human putative tRNA(1-methyladenosine)methyltransferase

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

hypothetical protein

Homo sapiens

UniProt Q9BVS5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 S-ADENOSYLMETHIONINE × 4 UNKNOWN ATOM OR ION × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9BVS5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–336; UniProt 144–477 作者链 B; PDB构建体 3–336; UniProt 144–477

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2b25
沉积日期 deposition_date2005-09-16
结构标题 titleHuman putative tRNA(1-methyladenosine)methyltransferase
关键词 keywordsstructural genomics, methyl transferase, sam, Structural Genomics Consortium, SGC, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2b25__assembly_1__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 2b25__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
3 1 2b25__assembly_3__model_1 tetrameric (4) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2b25a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family familyc.66.1.13 — tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase-like
结构域编号 domain_idd2b25b_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
家族 Family familyc.66.1.13 — tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2b25A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2b25A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
结构域编号 domain_id2b25B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id2b25B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — Vaccinia Virus protein VP39
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7. 引用文献 (1)