2b89

Structural basis for molecular recognition in an affibody:affibody complex

Method: SOLUTION NMR

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

anti-ZTaq affibody

Staphylococcus aureus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q70AB8_STAAU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–58； UniProt 117–173

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2b89
沉积日期 deposition_date	2005-10-06
结构标题 title	Structural basis for molecular recognition in an affibody:affibody complex
关键词 keywords	PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS, PROTEIN ENGINEERING, MOLECULAR RECOGNITION, NMR SPECTROSCOPY, INDUCED FIT, AFFIBODY, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2b89__assembly_1__model_38

Assembly 1 · Model 38 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2b89__assembly_1__model_38 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2b89__assembly_1__model_38 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	12.33 Å
Rg（电子密度）	11.32 Å
总 Rg	12.68 Å
原子数	920
残基数	58
排除体积	8058 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2b89__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2b89__assembly_1__model_2`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`2b89__assembly_1__model_3`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`2b89__assembly_1__model_4`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`2b89__assembly_1__model_5`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`2b89__assembly_1__model_6`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`2b89__assembly_1__model_7`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`2b89__assembly_1__model_8`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`2b89__assembly_1__model_9`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`2b89__assembly_1__model_10`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`2b89__assembly_1__model_11`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`2b89__assembly_1__model_12`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`2b89__assembly_1__model_13`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`2b89__assembly_1__model_14`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`2b89__assembly_1__model_15`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`2b89__assembly_1__model_16`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`2b89__assembly_1__model_17`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`2b89__assembly_1__model_18`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`2b89__assembly_1__model_19`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`2b89__assembly_1__model_20`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`2b89__assembly_1__model_21`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`2b89__assembly_1__model_22`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`2b89__assembly_1__model_23`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`2b89__assembly_1__model_24`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`2b89__assembly_1__model_25`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`2b89__assembly_1__model_26`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`2b89__assembly_1__model_27`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`2b89__assembly_1__model_28`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`2b89__assembly_1__model_29`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`2b89__assembly_1__model_30`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	31	`2b89__assembly_1__model_31`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	32	`2b89__assembly_1__model_32`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	33	`2b89__assembly_1__model_33`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	34	`2b89__assembly_1__model_34`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	35	`2b89__assembly_1__model_35`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	36	`2b89__assembly_1__model_36`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	37	`2b89__assembly_1__model_37`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	38	`2b89__assembly_1__model_38`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	39	`2b89__assembly_1__model_39`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	40	`2b89__assembly_1__model_40`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2b89a_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.8 — immunoglobulin/albumin-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.8.1 — Bacterial immunoglobulin/albumin-binding domains
家族 Family family	a.8.1.1 — Immunoglobulin-binding protein A modules

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	2b89A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Immunoglobulin FC, subunit C

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描述 description	anti-ZTaq affibody
分子量 formula_weight	6427.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	36800

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

Structural basis for molecular recognition in an affibody:affibody complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

anti-ZTaq affibody

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2b89__assembly_1__model_38

2b89__assembly_1__model_38 | I(q)

2b89__assembly_1__model_38 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Structural basis for molecular recognition in an affibody:affibody complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

anti-ZTaq affibody

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2b89__assembly_1__model_38

2b89__assembly_1__model_38 | I(q)

2b89__assembly_1__model_38 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)