Vibrio parahaemolyticus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ZINC ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ZINC ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | ASTE_VIBPA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 B； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 |
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| 条目编号 entry_id | 2bco |
| 沉积日期 deposition_date | 2005-10-19 |
| 结构标题 title | X-ray structure of succinylglutamate desuccinalase from Vibrio Parahaemolyticus (RIMD 2210633) at the resolution 2.3 A, Northeast Structural Genomics Target Vpr14 |
| 关键词 keywords | NESG, VPR14, Structural Genomics, PSI, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.94 Å |
| Rg（电子密度） | 18.58 Å |
| 总 Rg | 19.65 Å |
| 原子数 | 2342 |
| 残基数 | 288 |
| 排除体积 | 41759 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2bcoa1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.56 — Phosphorylase/hydrolase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.56.5 — Zn-dependent exopeptidases |
| 家族 Family family | c.56.5.7 — AstE/AspA-like |
| 结构域编号 domain_id | d2bcob_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.56 — Phosphorylase/hydrolase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.56.5 — Zn-dependent exopeptidases |
| 家族 Family family | c.56.5.7 — AstE/AspA-like |
| 结构域编号 domain_id | 2bcoA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 630 — Aminopeptidase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zn peptidases |
| 结构域编号 domain_id | 2bcoA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 630 — |
| 结构域编号 domain_id | 2bcoB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 630 — Aminopeptidase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Zn peptidases |