2ben

Crystal structure of the Serratia marcescens chitin-binding protein CBP21 Y54A mutant.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CBP21

SERRATIA MARCESCENS

UniProt O83009

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O83009
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–170; UniProt 28–197 作者链 B; PDB构建体 1–170; UniProt 28–197

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ben
沉积日期 deposition_date2004-11-26
结构标题 titleCrystal structure of the Serratia marcescens chitin-binding protein CBP21 Y54A mutant.
关键词 keywordsCHITIN-BINDING PROTEIN, CHITIN DEGRADATION, CHITIN-BINDING, FNIII-LIKE FOLD; CHITIN-BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ben__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ben__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ben__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)15.81 Å
Rg(电子密度)14.44 Å
总 Rg15.65 Å
原子数1313
残基数170
排除体积22965 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ben__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2ben__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2bena_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.2 — E-set domains of sugar-utilizing enzymes
结构域编号 domain_idd2benb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.2 — E-set domains of sugar-utilizing enzymes

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2benA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Coagulation Factor XIII; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — chitin-binding protein cbp21
结构域编号 domain_id2benB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Coagulation Factor XIII; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — chitin-binding protein cbp21
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7. 引用文献 (1)